Эмпирическое назначение азитромицина изменяет микробиом и резистом верхних дыхательных путей без противовоспалительного эффекта при COVID-19

Почему это важно для повседневного использования антибиотиков

В первые месяцы пандемии COVID-19 многие пациенты получали антибиотик азитромицин в надежде, что он смягчит вредное воспаление или поможет бороться с вирусом. В этом исследовании поставлен на первый взгляд простой, но ключевой вопрос: что на самом деле вызвало столь массовое применение антибиотика в носу и горле пациентов — тех местах, где вирус сначала закрепляется? Отслеживая более тысячи госпитализированных взрослых, исследователи показывают, что азитромицин заметно нарушал сообщество микробов в верхних дыхательных путях и усиливал экспрессию генов резистентности к антибиотикам — при этом не давая ожидаемого противовоспалительного эффекта.

Как было организовано исследование

Учёные опирались на общенациональный проект в США, наблюдавший 1 164 взрослых, госпитализированных с COVID-19 в 20 больницах в 2020–2021 годах. Пациенты естественным образом разделились на три группы: получавшие эмпирически азитромицин, те, кому назначали другие антибиотики, и те, кто не получал антибиотиков. По повторно взятым носовым мазкам в течение месяца команда с помощью метода метатранскриптомики определяла, какие микроорганизмы активны и какие гены резистентности экспрессируются. Также секвенировали иммунные гены из крови и клеток носа, чтобы оценить, изменяет ли азитромицин воспалительную реакцию пациентов.

Что случилось с микросожителями дыхательных путей

Уже через сутки после начала приёма азитромицина общее количество бактерий в носу снизилось, и это снижение было заметно и примерно через пять дней лечения. Однако утрата была неравномерной. Микроорганизмы, обычно безвредные в верхних дыхательных путях — такие как Neisseria и Fusobacterium — как правило сокращались. В то же время виды, способные вызывать заболевания, включая некоторые Staphylococcus и Klebsiella, становились более распространёнными. Также наблюдалось увеличение доли грибов за тот же период, что указывает на то, что когда бактериальные соседи подавляются, другие организмы могут занять освободившуюся нишу.

Скрытые сдвиги в генах резистентности

Помимо учёта присутствующих микробов, исследователи сосредоточились на «резистоме» — совокупности генов, позволяющих бактериям противостоять антибиотикам. Азитромицин относится к семейству макролидов, и команда обнаружила, что гены, обеспечивающие резистентность к макролидам и родственным препаратам, быстро расширялись. Уже через несколько дней лечения число различных экспрессируемых генов резистентности к макролидам было примерно на 50–70 % выше у пациентов, получавших азитромицин, по сравнению с теми, кто не получал антибиотиков или получал другие препараты. Доля резистома, приходящаяся на эти макролидо-резистентные гены, почти удвоилась и, что примечательно, эти изменения сохранялись неделю и более после прекращения приёма антибиотика.

Какие микробы несут новые механизмы защиты

Связывая гены резистентности с присутствующими бактериями, исследование связало эти макролид-оборонительные механизмы как с привычными патогенами, так и с обычно безвредными обитателями. Потенциально патогенные роды, такие как Staphylococcus и Streptococcus, были тесно ассоциированы с ключевыми генами резистентности, например ermA и msrA, что подразумевает, что обычные возбудители пневмонии могут стать труднее поддающимися лечению после воздействия азитромицина. В то же время повседневные жители носа, включая Corynebacterium и Dolosigranulum, также показали связь с генами резистентности, что говорит о том, что верхние дыхательные пути могут служить тихим резервуаром, где накапливается и потенциально распространяется устойчивость к антибиотикам.

Отсутствие доказанного ожидаемого эффекта успокоения воспаления

У азитромицина есть репутация вещества, уменьшающего воспаление при хронических заболеваниях лёгких, поэтому многие клиницисты надеялись, что он ослабит чрезмерные иммунные реакции при тяжёлом COVID-19. Однако при сравнении паттернов активности иммунных генов в крови и клетках носа у пациентов, получавших и не получавших азитромицин, исследователи не обнаружили значимых различий. Уровни вируса SARS-CoV-2 в носу также выглядели схожими между группами. Другими словами, хотя препарат ясно изменял микробиом и резистом, он, по-видимому, не снижал вредное воспаление и не уменьшал количество вируса у госпитализированных пациентов.

Что это означает для пациентов и общественного здравоохранения

В совокупности эти результаты формируют предостерегающее представление. В большой когорте госпитализированных с вирусной инфекцией эмпирическое назначение азитромицина не показало измеримой противовоспалительной или противовирусной пользы, зато способствовало росту и активности генов резистентности в верхних дыхательных путях и смещало сообщество микробов в сторону более потенциально вредных видов. Для отдельных пациентов это может повысить риск последующих бактериальных инфекций, труднее поддающихся лечению. На популяционном уровне такое применение усугубляет проблему антибиотикорезистентности. Работа подчёркивает простое послание для клиников и широкой общественности: при вирусных заболеваниях вроде COVID-19 использование антибиотиков «на всякий случай» может иметь долговременные негативные последствия, поэтому бережное, обоснованное применение антибиотиков важно для сохранения их эффективности там, где они действительно необходимы.

Цитирование: Glascock, A., Maguire, C., Phan, H.V. et al. Empiric azithromycin alters the upper respiratory microbiome and resistome without anti-inflammatory benefit in COVID-19. Nat Microbiol 11, 1100–1112 (2026). https://doi.org/10.1038/s41564-026-02285-8

Ключевые слова: азитромицин, COVID-19, микробиом дыхательных путей, антибиотикорезистентность, рациональное использование антибиотиков