ナノポア読み取りから高品質メタゲノムアセンブリを行う nanoMDBG

ひとつまみの土に潜む見えない生命を読む

土のひとつまみや腸液の一滴には、培養できない種を含め数千種の微生物がひしめいています。それらが何者で何をしているのかを知るために、科学者は環境から直接DNAを読み取ります。これがメタゲノミクスです。この記事では、携帯型DNAシーケンサーの生データを高品質なドラフトゲノムに変換する新しい計算手法、nanoMDBGを紹介します。これにより、複雑な微生物世界を従来よりも速く、安価に、そしてはるかに詳細に地図化する道が開かれます。

引用: Benoit, G., James, R., Raguideau, S. et al. High-quality metagenome assembly from nanopore reads with nanoMDBG. Nat Commun 17, 3556 (2026). https://doi.org/10.1038/s41467-026-69760-y

キーワード: メタゲノミクス, ナノポアシーケンシング, ゲノムアセンブリ, マイクロバイオーム, バイオインフォマティクス