Modifications de la composition du microbiote intestinal après consommation de kéfir d’eau chez des adultes en bonne santé

Pourquoi une boisson pétillante compte pour votre intestin

De nombreuses personnes se tournent vers les boissons fermentées pour soutenir la digestion et le bien-être général. Cette étude s’est intéressée au kéfir d’eau, une boisson à base végétale, légèrement pétillante, que l’on peut facilement préparer chez soi. Les chercheurs voulaient savoir si boire du kéfir d’eau chaque jour pendant deux semaines pouvait remodeler en douceur la communauté microbienne de l’intestin chez des adultes en bonne santé, et si les participants remarquaient des changements digestifs à court terme.

Un cousin végétal du kéfir laitier

Le kéfir d’eau est obtenu en faisant fermenter de l’eau sucrée avec de petits grains gélatineux qui renferment des bactéries et des levures amies. Contrairement au kéfir laitier, il est naturellement sans lactose et convient aux régimes végétaliens et à base de plantes. Les grains sont intégrés dans une matrice de sucres et de protéines produite par les microbes eux-mêmes, et la boisson résultante contient des micro-organismes vivants ainsi que des composés tels que des vitamines, des acides gras à chaîne courte et d’autres produits de fermentation. Alors que le kéfir laitier a fait l’objet de nombreuses études chez l’homme, le kéfir d’eau a surtout été examiné en laboratoire et chez l’animal, de sorte que ses effets chez l’humain restaient peu clairs.

Comment l’étude a été menée dans la vie quotidienne

Quarante adultes vivant en Suède ont préparé du kéfir d’eau à domicile en utilisant une recette standard et du matériel fourni par l’équipe de recherche. Ils ont fait fermenter la boisson à température ambiante, ont filtré les grains et les fruits, puis ont bu 200 millilitres chaque jour pendant 14 jours tout en conservant leurs habitudes alimentaires habituelles et en évitant d’autres produits probiotiques ou fermentés. Chaque participant a prélevé un échantillon de selles juste avant de commencer et de nouveau à la fin des deux semaines. Ces échantillons ont été congelés puis analysés ultérieurement à l’aide de méthodes basées sur l’ADN pour identifier quelles bactéries étaient présentes et comment leurs proportions relatives ont évolué au fil du temps.

Ressenti digestif pendant les deux semaines

Les participants ont également rempli des questionnaires en ligne sur les ballonnements, les gaz et les inconforts gastriques avant et après la consommation de kéfir d’eau. Les expériences ont été diverses. Environ un tiers a signalé plus de gaz et environ un quart a constaté une augmentation des ballonnements, effets souvent observés lorsqu’on introduit de nouveaux micro-organismes vivants dans l’alimentation. En même temps, plus d’un quart a rapporté moins de douleurs abdominales, et les deux tiers n’ont pas remarqué de changement net dans le confort digestif. Quelques personnes ont mentionné une douleur abdominale passagère, mais la plupart n’ont pas signalé ce symptôme.

Évolutions au sein de la communauté microbienne cachée

Lorsque les chercheurs ont examiné les microbes intestinaux, ils ont constaté que le nombre total et la diversité d’espèces chez chaque personne restaient à peu près stables. Cependant, l’équilibre entre les groupes bactériens a changé après les deux semaines de kéfir d’eau. Un groupe majeur, les Firmicutes, est devenu moins fréquent, tandis que des groupes appelés Bacteroidetes et Actinobacteria ont augmenté. Au sein de ces grands groupes, plusieurs espèces connues pour dégrader les sucres complexes et produire des acides gras à chaîne courte sont devenues plus abondantes. Il s’agit notamment d’espèces de Blautia, de Roseburia faecis, et d’habitants courants de l’intestin tels que Bacteroides fragilis, Bacteroides uniformis, Gemmiger formicilis, Prevotella copri et Parabacteroides distasonis. Ensemble, ces microbes contribuent à transformer les glucides alimentaires en petites molécules qui peuvent nourrir les cellules intestinales et soutenir potentiellement la fonction de la barrière intestinale.

Ce qui vient de la boisson et ce qui existait déjà

L’équipe a également comparé les bactéries présentes dans le kéfir d’eau avec celles vivant dans l’intestin des participants. Certains types se recoupaient, notamment Lactobacillus, Bifidobacterium et Prevotella. Dans l’intestin, les niveaux de Bifidobacterium et de Prevotella ont augmenté après l’intervention, tandis que d’autres genres ont diminué ou sont restés stables. Plusieurs bactéries intestinales bénéfiques, comme Blautia et Roseburia, n’étaient pas du tout présentes dans la boisson mais ont néanmoins augmenté, ce qui suggère que le kéfir d’eau peut nourrir des résidents existants plutôt que de simplement en ajouter de nouveaux. Les sucres dissous de la boisson et les sous-produits microbien, en particulier certains polysaccharides spécifiques formés pendant la fermentation, peuvent servir d’aliment pour ces microbes bénéfiques.

Ce que cela signifie pour les buveurs au quotidien

Globalement, l’étude suggère que boire du kéfir d’eau fait maison pendant deux semaines peut remodeler légèrement la communauté microbienne intestinale chez des adultes en bonne santé, en favorisant des bactéries qui se nourrissent de sucres et produisent des acides bénéfiques, sans modifier radicalement la diversité globale. Certaines personnes ont connu des gaz ou des ballonnements temporaires, tandis que d’autres ont ressenti moins de douleurs abdominales, et beaucoup n’ont remarqué aucune différence. Parce que l’étude était petite, de courte durée et sans groupe témoin séparé, elle ne peut pas établir de relation de cause à effet ni prédire des résultats de santé à long terme. Elle fournit toutefois des preuves préliminaires que cette boisson fermentée d’origine végétale peut interagir avec notre écosystème interne, et souligne la nécessité d’études plus longues et plus détaillées pour évaluer la durabilité et l’importance clinique de ces changements.

Citation: de Mel, R., Al Khafaji, A.H., Muthusamy, S. et al. Changes in gut microbiota composition following water kefir consumption in healthy adults. Sci Rep 16, 16006 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-53645-7

Mots-clés: kéfir d’eau, microbiote intestinal, aliments fermentés, acides gras à chaîne courte, potentiel probiotique