Перспективное многоцентровое исследование транскриптомики слизистой верхних дыхательных путей выявляет два основных эндотипа критически больных пациентов с COVID-19

Почему это важно для пациентов и их семей

Даже спустя годы совместной жизни с COVID-19 врачам по-прежнему трудно объяснить, почему у некоторых людей при инфицировании вариантом Омикрон развивается критическое заболевание, а у других — нет. Это исследование фокусируется на слизистой носа и верхних дыхательных путей у пациентов, настолько тяжелобольных, что требовалась реанимация, и задаёт простой, но важный вопрос: существуют ли разные «типы» иммунных реакций в дыхательных путях, и могут ли эти невидимые паттерны однажды помочь подобрать более персонализированное лечение?

Смотреть в нос, а не только в кровь

Большинство госпитальных тестов при тяжёлом COVID-19 ориентированы на анализы крови, сканы и уровень кислорода. Но вирус первично оседает и размножается в носу и горле, где иммунная система разворачивает свои первые защитные реакции. В этом многоцентровом французском исследовании учёные собрали стандартные носовые мазки у 94 взрослых, поступивших в отделения интенсивной терапии с угрожающей жизни пневмонией, связанной с Омикроном, в период с весны 2022 по лето 2023 года. Из этих мазков они извлекли и секвенировали человеческие генетические молекулы — РНК — чтобы увидеть, какие иммунно-связанные гены включены или отключены в эпителии дыхательных путей. С помощью математического кластерного метода, ориентированного на молекулы клеточной сигнализации — цитокины, — пациентов сгруппировали исключительно по признакам иммунной активности в верхних дыхательных путях.

Два скрытых иммунных «типа» в дыхательных путях

Среди 56 пациентов с данными хорошего качества анализ выявил два чётких иммунных паттерна в верхних дыхательных путях, которые команда назвала COVID-19 Immune Transcriptomic Respiratory Profiles, или CITRP-1 и CITRP-2. Обе группы были схожи по возрасту, сопутствующим заболеваниям, статусу вакцинации, вирусной нагрузке и общей тяжести состояния при поступлении в реанимацию. При этом их иммунная активность в дыхательных путях выглядела очень по-разному. Пациенты группы CITRP-2 демонстрировали значительно более выраженный воспалительный ответ, с повышенной активностью генов, связанных с ранней, быстро действующей защитой, а также с определёнными хелперными Т-клетками, которые вызывают воспаление, напоминающее аллергию и астму. Напротив, у пациентов CITRP-1 профиль слизистой был более приглушённым и менее воспалённым, несмотря на одинаковую клиническую тяжесть.

Когда защитники становятся вредными

Гиперактивный паттерн в CITRP-2 был сосредоточен вокруг типа белых кровяных клеток — нейтрофилов, которые устремляются в очаги инфекции и выделяют токсичные гранулы и сетевидные структуры, чтобы уничтожать микробы. У этой группы была более высокая активность генетических путей, связанных с дегрануляцией нейтрофилов, фагоцитозом микроорганизмов и сенсорами, распознающими вирусные компоненты. Также усиливались сигналы, связанные с так называемым Th2-ответом, вовлекающим молекулы, похожие на те, что наблюдаются при аллергиях и астме. Одним из заметных сигналов была хемокина, особенно сильно привлекающая нейтрофилы в очаг инфекции. С помощью вычислительных инструментов авторы оценили, что у пациентов CITRP-2 в носовой ткани было больше нейтрофилов и меньше Т-клеток, уничтожающих вирус, чем у пациентов CITRP-1, что указывает на сдвиг к «горячему», насыщенному нейтрофилами фронту, который, пытаясь очистить вирус, может повреждать тонкие структуры дыхательных путей.

Та же клиника, разная биология

Удивительно, но эти выраженные иммунные различия не проявлялись в очевидных отличиях у постели больного. Частота искусственной вентиляции легких, органной поддержки, осложнений, таких как вентиляторно‑ассоциированная пневмония, длительность пребывания в реанимации и смертность к 28 дням были сходны в двух эндотипах. Единственным рутинным лабораторным показателем, который явно отличался, была более низкая скорость лимфоцитов в крови у более воспалённой группы CITRP-2. Авторы отмечают, что поскольку все пациенты в исследовании уже были критически больны, выявить связь между иммунными профилями и исходами может быть сложнее, чем при включении пациентов с более лёгким течением. Тем не менее факт, что две биологически разные группы выглядят почти одинаково при стандартных клинических методах, подчёркивает, сколько важной информации в настоящее время остаётся скрытой от рутинной практики.

К более персонализированному лечению тяжёлого COVID-19

Главный вывод исследования состоит в том, что тяжёлый COVID-19, вызванный Омикроном и леченный в реанимации, не является единым заболеванием, даже когда пациенты выглядят очень похоже. По крайней мере два различных иммунных паттерна в дыхательных путях существуют: один относительно сдержанный, а другой — доминируемый интенсивным нейтрофильно‑ и Th2‑опосредованным воспалением, которое само по себе может способствовать повреждению лёгких. В настоящее время большинству критически больных дают один и тот же набор противовоспалительных препаратов. Авторы утверждают, что будущее лечение должно смещаться в сторону подбора терапии по скрытым иммунным эндотипам — например, избирательного подавления активности нейтрофилов или конкретных цитокинов в наиболее воспалённой подгруппе. Хотя нужны дополнительные и более крупные исследования, особенно с включением лиц с менее тяжёлым течением, эта работа показывает, что простой носовой мазок однажды может помочь врачам выбрать правильное иммунно‑направленное лечение для нужного пациента в нужное время.

Цитирование: Bay, P., Boizeau, L., Préau, S. et al. Prospective multicentre study of upper respiratory mucosal transcriptomics reveals two major endotypes of critically ill COVID-19 patients. Commun Med 6, 238 (2026). https://doi.org/10.1038/s43856-026-01474-0

Ключевые слова: COVID-19, вариант Омикрон, иммунный ответ, нейтрофилы, персонализированная медицина