Potencjał sekwencjonowania całego genomu w farmakogenetyce: retrospektywne badanie dokumentacji medycznej u pacjentów z chorobami rzadkimi

Dlaczego twoje DNA ma znaczenie dla codziennych leków

Wielu ludzi doświadczyło sytuacji, gdy lek nie działa zgodnie z oczekiwaniami lub powoduje silne działania niepożądane. To badanie stawia proste, ale istotne pytanie: gdyby lekarze rutynowo mieli dostęp do całego DNA pacjenta, czy mogliby wykorzystać te informacje do wyboru bezpieczniejszych i skuteczniejszych leków, zwłaszcza u osób z złożonymi, przewlekłymi schorzeniami?

Analiza już zarchiwizowanych genomów

Zespół badawczy skupił się na farmakogenetyce, czyli badaniu, jak nasze geny wpływają na sposób przetwarzania leków. Zamiast zlecać nowe testy wyłącznie w celu oceny reakcji na leki, wykorzystali sekwencjonowanie całego genomu, które już wykonano u 1000 osób badanych pod kątem chorób rzadkich oraz u niektórych ich krewnych. Pacjenci ci często przyjmują wiele leków przez całe życie, więc stanowią dobrą grupę do sprawdzenia wartości przepisywania opartego na DNA. Z pełnego zestawu danych DNA zespół obliczył, które wersje kluczowych genów związanych z lekami nosi każda osoba i powiązał to z obowiązującymi wytycznymi terapeutycznymi.

Wykrywanie genetycznych wskazówek mogących zmienić leczenie

Naukowcy przeanalizowali 12 genów, o których wiadomo, że wpływają na sposób, w jaki organizm radzi sobie z powszechnymi lekami, takimi jak środki przeciwbólowe, leki zmniejszające wydzielanie kwasu żołądkowego, leki przeciwdepresyjne czy leki przeciwzakrzepowe. Następnie sprawdzili elektroniczne dokumentacje medyczne dla 359 osób, których historie przyjmowania leków były dostępne. Wyniki były uderzające: 97 procent ze wszystkich 1000 uczestników miało przynajmniej jeden wariant genetyczny, który według aktualnych wytycznych mógłby uzasadniać zmianę wyboru leku lub dawki. Wśród osób z danymi o receptach około jedna na trzy faktycznie otrzymała co najmniej jeden lek, dla którego ich indywidualny profil genetyczny sugerowałby zmianę terapii lub dokładniejsze monitorowanie.

Ukryte zmiany, które prostsze testy mogą przeoczyć

Standardowe testy genetyczne zazwyczaj sprawdzają jedynie ustalony zestaw dobrze znanych wariantów. Sekwencjonowanie całego genomu natomiast obejmuje cały zapis DNA i może ujawnić rzadsze zmiany oraz strukturalne niuanse, takie jak brakujące lub zduplikowane fragmenty genu. W tym badaniu zespół wykorzystał pełne dane genomowe do poszukiwania tych mniej oczywistych modyfikacji w 34 genach związanych z lekami, a następnie skupił się na 12 genach, dla których istnieją jasne zalecenia dotyczące przepisywania leków. Stwierdzili, że 29 osób nosiło albo rzadkie warianty dysruptywne, albo większe brakujące lub dodatkowe fragmenty tych genów. W niemal jednej trzeciej tych przypadków ta dodatkowa informacja zmieniłaby klasyfikację typu metabolizmu leku u pacjenta i mogła doprowadzić do innych zaleceń terapeutycznych.

Dlaczego pacjenci z chorobami rzadkimi są szczególnym przypadkiem

Osoby z chorobami rzadkimi często konsultują wielu specjalistów, przechodzą liczne badania i otrzymują wiele długotrwałych recept. W ich przypadku ponowne wykorzystanie istniejących danych z sekwencjonowania całego genomu do wskazówek dotyczących leków może być szczególnie przydatne. Badanie pokazuje, że przy umiarkowanym dodatkowym nakładzie analitycznym ten sam genom, który pomógł w ustaleniu diagnozy rzadkiej choroby, może także wskazać leki, które dla danej osoby mogą być mniej bezpieczne lub mniej skuteczne. To eliminuje konieczność wykonywania odrębnych testów panelowych za każdym razem, gdy rozważa się nowy lek, i pozostawia możliwość ponownej analizy w miarę odkrywania nowych powiązań gen–lek.

Co to oznacza dla przyszłej opieki medycznej

Autorzy wnioskują, że wykorzystanie danych z całego genomu do testów farmakogenetycznych mogłoby przynieść korzyści wielu pacjentom, choć najefektywniejszy kosztowo sposób wdrożenia takiego rozwiązania wymaga jeszcze dopracowania. Prawie każdy uczestnik badania miał różnice genetyczne istotne dla leczenia farmakologicznego, a znacząca część już otrzymała leki, które według wytycznych należałoby dostosować na podstawie ich DNA. Choć rzadkie i złożone zmiany genetyczne występowały rzadziej, czasami wpływały w istotny sposób na zalecenia terapeutyczne. Razem wyniki te wspierają wizję przyszłości, w której jedno, kompleksowe odczytanie DNA osoby może być wykorzystywane przez całe życie, pomagając lekarzom wybierać bezpieczniejsze i bardziej dopasowane leki.

Cytowanie: Gorny, M., Just, K.S., Krüger, T. et al. The potential of whole genome sequencing in pharmacogenetics: a retrospective health record study in rare disease patients. Eur J Hum Genet 34, 691–703 (2026). https://doi.org/10.1038/s41431-026-02025-w

Słowa kluczowe: farmakogenetyka, sekwencjonowanie całego genomu, odpowiedź na lek, choroba rzadka, medycyna spersonalizowana