Le potentiel du séquençage génomique complet en pharmacogénétique : une étude rétrospective des dossiers de santé chez des patients atteints de maladies rares

Pourquoi votre ADN compte pour les médicaments du quotidien

Beaucoup ont déjà connu l’expérience d’un médicament qui ne fonctionne pas comme attendu ou qui provoque des effets secondaires importants. Cette étude pose une question simple mais cruciale : si les médecins pouvaient lire systématiquement l’intégralité de l’ADN d’une personne, pourraient-ils utiliser cette information pour choisir des médicaments plus sûrs et plus efficaces, en particulier chez les personnes atteintes de maladies complexes et chroniques ?

Exploiter des génomes complets déjà disponibles

L’équipe de recherche s’est concentrée sur la pharmacogénétique, l’étude de la façon dont nos gènes influencent le traitement des médicaments par l’organisme. Plutôt que de prescrire de nouveaux tests spécifiques à la réponse médicamenteuse, elle a tiré parti du séquençage du génome complet déjà réalisé pour 1 000 personnes évaluées pour des maladies rares, ainsi que pour certains de leurs proches. Ces patients prennent souvent de nombreux médicaments au cours de leur vie, ce qui en fait un groupe pertinent pour explorer la valeur d’une prescription guidée par l’ADN. À partir de l’ensemble des données génomiques, l’équipe a déterminé quelles versions des gènes clés liés aux médicaments chaque personne portait et a relié ces informations aux recommandations de traitement existantes.

Détecter des indices génétiques susceptibles de modifier le traitement

Les chercheurs ont examiné 12 gènes connus pour influencer la manière dont l’organisme traite des médicaments courants tels que les analgésiques, les antiplaques gastriques, les antidépresseurs et les anticoagulants. Ils ont ensuite consulté les dossiers de santé électroniques de 359 personnes dont l’historique médicamenteux était disponible. Les résultats sont frappants : 97 % des 1 000 participants présentaient au moins un variant génétique que les recommandations actuelles considèrent comme susceptible de justifier un ajustement du choix du médicament ou de la posologie. Parmi ceux disposant de données de prescription, environ un sur trois avait effectivement reçu au moins un médicament pour lequel leur profil génétique personnel recommanderait un changement de thérapie ou une surveillance plus étroite.

Modifications cachées que des tests plus simples peuvent manquer

Les tests génétiques standard ciblent généralement une liste fixe de variants bien connus. Le séquençage du génome complet, en revanche, couvre la séquence d’ADN dans son intégralité et peut révéler des modifications plus rares et des particularités structurelles, comme des régions d’un gène manquantes ou dupliquées. Dans cette étude, l’équipe a utilisé les données génomiques complètes pour rechercher ces altérations moins évidentes dans 34 gènes liés aux médicaments, puis s’est concentrée sur les 12 pour lesquels il existe des recommandations claires de prescription. Ils ont constaté que 29 personnes portaient soit des variants rares perturbateurs, soit des segments manquants ou supplémentaires de ces gènes. Dans près d’un tiers de ces cas, cette information supplémentaire aurait modifié la manière dont les médecins classent le type de métabolisme médicamenteux du patient et aurait pu conduire à des conseils thérapeutiques différents.

Pourquoi les patients atteints de maladies rares sont un cas particulier

Les personnes atteintes de maladies rares consultent souvent de nombreux spécialistes, subissent des examens répétés et reçoivent plusieurs prescriptions à long terme. Pour elles, la réutilisation des données de séquençage du génome complet à des fins d’orientation médicamenteuse pourrait être particulièrement utile. L’étude montre qu’avec un effort d’analyse supplémentaire modéré, le même génome qui a aidé au diagnostic d’une affection rare peut aussi signaler des médicaments susceptibles d’être moins sûrs ou moins efficaces pour cette personne. Cela évite la nécessité de réaliser des panels de tests distincts à chaque fois qu’un nouveau médicament est envisagé et permet la réanalyse si de nouveaux liens gène–médicament sont découverts.

Ce que cela implique pour les soins futurs

Les auteurs concluent que l’utilisation des données du génome complet pour la pharmacogénétique pourrait bénéficier à de nombreux patients, même si la méthode la plus rentable de mise en œuvre reste à déterminer. Presque tous les participants à l’étude présentaient des différences génétiques pertinentes pour le traitement médicamenteux, et une part notable avait déjà reçu des médicaments que les recommandations suggèrent d’ajuster en fonction de leur ADN. Bien que les modifications génétiques rares et complexes soient moins fréquentes, elles ont parfois modifié de manière significative la thérapie recommandée. Ensemble, ces résultats soutiennent un avenir où une lecture unique et complète de l’ADN d’une personne pourrait être réutilisée tout au long de la vie pour aider les médecins à choisir des médicaments plus sûrs et mieux adaptés.

Citation: Gorny, M., Just, K.S., Krüger, T. et al. The potential of whole genome sequencing in pharmacogenetics: a retrospective health record study in rare disease patients. Eur J Hum Genet 34, 691–703 (2026). https://doi.org/10.1038/s41431-026-02025-w

Mots-clés: pharmacogénétique, séquençage du génome complet, réponse aux médicaments, maladie rare, médecine personnalisée