地中海におけるカラスザメ Chimaera monstrosa (Linnaeus, 1758) の遺伝的多様性と系統地理学：ミトコンドリアCOI解析からの知見

古代の深海魚が伝える現代の保全の物語

波の何百メートル下に隠れて、ウサギのような姿からウサギザメやゴーストシャークと呼ばれるあまり知られていない魚が地中海と大西洋の海底を滑るように移動しています。サメと神話的な生き物の混成のように見えることもありますが、この動物は実在し、脅かされているとされます。本研究は、個体群が海の遠く離れた場所でどのように関連しているかを、DNAのごく小さな違いを手掛かりにどこに別個の集団が存在し、どのように保護されるべきかを理解しようとしました。

深海の内気な住人

本研究の中心種である Chimaera monstrosa は、顎を持つ脊椎動物の最も古い系統の一つに属します。これらの深海魚は軟骨質の骨格を持ち、オスの頭部にある把持器官や長い革質の卵嚢といった独特の特徴があります。深度は約200メートルから1,600メートル以上に及び、北東大西洋と地中海全域に分布します。表層からは遠く、漁網にかかることも稀なため、異なる個体群がどのように結びついているか、また人間の活動がどのように影響しているかについては驚くほど知られていません。

水中地図の空白を埋める

これまでの遺伝学的研究は、大西洋と地中海のゴーストシャークが別個の群を形成していることを示唆していましたが、トルコ沿岸を含む東地中海からのサンプルは欠けていました。本研究では、流域の東端にあるイスケンデルン湾の底引き曳網漁で発生した稀な混獲を利用しました。研究者たちは、深海から急激に引き上げられたために残念ながら生存しなかった5匹の個体から小さな筋肉サンプルを採取し、実験室でDNAを抽出しました。チームは、細胞のエネルギー産生装置にある、個体間比較のバーコードのように使われる一般的な遺伝子マーカーの領域に注目しました。

遺伝的な移動の履歴を読む

トルコ海域から得られた新しいDNA配列は、地中海と大西洋での以前の研究からの一致する60配列とともに解析されました。系統樹法と、異なる遺伝変異がどのように分岐し広がるかを示す図を用いて、研究者らはトルコ産ゴーストシャークがどこに位置するかを調べました。5匹はいずれも既存の地中海群にしっかり属し、イタリアやイスラエル、その他の地域の個体とまったく同一の遺伝型を共有していました。対照的に、地中海の個体はいずれも大西洋の個体とはこれらの遺伝型を共有していませんでした。統計検定は、このDNA領域における遺伝的差異の大部分が海盆間で分かれており、海盆内よりも大きいことを示しましたが、全体としての差はかなり小さいことも示されました。

海が語るパターンの意味

遺伝的ネットワーク解析は、採取された全ゴーストシャークで約30の異なる変異型を明らかにし、多様性が豊かである一方、変異型同士の差は穏やかであることを示しました。このパターンと変異型のクラスタリングの仕方は、地域ごとの個体群が長期間にわたり部分的に分離してきた歴史を示唆しつつも、多くの近縁な系統を保持していることを示しています。ジブラルタル海峡付近を中心とする大西洋と地中海の境界は、混合を制限する部分的な“門”として働いているように見えます。氷期サイクルや海況の変動を通じて、この門は温度や深度の違いと合わせて、今日の大西洋と地中海の別個の系統を形作るのに寄与したと考えられます。ただし著者らは、統計検定の結果は過去の個体群増減の単純な証明ではなく記述的な要約として捉えるべきだと強調しています。

保護のためにこれらの発見が意味すること

たった5匹の新しい個体しか追加されていませんが、それらは以前にサンプリングされていなかった海岸域から得られ、種の遺伝地図における重要な盲点を埋めるのに寄与します。結果は、トルコの地中海産のウサギザメが局所的にユニークな枝を形成するのではなく、より広い地中海系統に属することを示しています。保全上さらに重要なのは、あらゆる証拠が地中海と大西洋のゴーストシャークの明確な分岐を指している点です。つまり各海盆は漁業圧、生息地の損傷、気候変動に対して異なる反応を示す可能性のある独立した生物学的単位を表している可能性が高いということです。著者らは、これらの単位を将来のリスク評価で独立して扱うべきだと主張し、より詳細な遺伝的手法を用いた広範な追加サンプリングが、この姿を精緻化し、これらの古代深海生物の有効な保護を導くために必要であると結論付けています。

引用: Başusta, N., Saglam, N. Genetic diversity and phylogeography of Chimaera monstrosa (Linnaeus, 1758) in the Mediterranean Sea: insights from COI mitochondrial DNA analysis. Sci Rep 16, 15797 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-45984-2

キーワード: ゴーストシャーク, 深海魚, 地中海, 集団遺伝学, 海洋保全