Séroprévalence du SARS-CoV-2 dans des communautés rurales du Burkina Faso (Afrique de l’Ouest) évaluée à partir de moustiques ayant pris un repas sanguin

Pourquoi les moustiques peuvent nous renseigner sur des infections passées au COVID

Dans de nombreuses régions rurales d’Afrique, les habitants sont éloignés des cliniques et des centres de dépistage, ce qui rend difficile d’évaluer l’étendue de la propagation du COVID-19. Des scientifiques travaillant au Burkina Faso se sont tournés vers un auxiliaire inattendu : des moustiques qui venaient de se nourrir de sang humain. En testant le sang contenu dans ces insectes, ils ont exploré si une simple capture de moustiques pouvait offrir une fenêtre sur les infections passées par le coronavirus dans des villages isolés.

Suivre la trace d’une pandémie cachée

Les chiffres officiels du COVID-19 au Burkina Faso, comme dans de nombreux pays africains, proviennent principalement des hôpitaux et des aéroports urbains. Pourtant, plus de la moitié de la population vit en zones rurales où les médecins, les laboratoires et les kits de test se font rares. Des études antérieures dans le pays ont montré que beaucoup plus de personnes portaient des anticorps contre le SARS-CoV-2 que ne le laissaient supposer les cas déclarés, en particulier dans les grandes villes. Ce qui restait largement inconnu, c’était l’ampleur de la circulation du virus dans les petites communautés, où la maladie pouvait se propager discrètement avec peu d’enregistrements.

Utiliser les moustiques villageois comme petits collecteurs de sang

Pour répondre à ce problème, les chercheurs se sont appuyés sur un concept appelé xénosurveillance, qui utilise des insectes hématophages comme substituts à un prélèvement direct chez l’humain. D’octobre à novembre 2021, ils ont visité onze villages situés à environ 50 kilomètres des deux plus grandes villes du Burkina Faso, Bobo-Dioulasso et Ouagadougou. Tôt chaque matin, après avoir obtenu l’autorisation des chefs de foyer, ils ont collecté des moustiques vivants se reposant dans les chambres et n’ont conservé que ceux présentant un abdomen visiblement gonflé, signe d’un repas sanguin récent. Chaque moustique a été stocké avec soin afin que les anticorps humains présents dans son intestin restent intacts pour les analyses.

Comment le sang des moustiques a été testé

De retour au laboratoire, les scientifiques ont disséqué les abdomens individuels des moustiques et mélangé le sang avec une simple solution saline. Ils ont ensuite utilisé des tests d’anticorps standard, semblables à ceux utilisés sur du sang humain, pour rechercher des protéines immunitaires reconnaissant la protéine Spike du coronavirus et son site de liaison au récepteur. Seuls les moustiques dont les échantillons ont réagi positivement aux deux tests au-delà de seuils définis ont été comptés comme positifs. Cette approche rigoureuse faisait de chaque insecte positif la preuve qu’au moins une personne qu’il avait piquée avait été infectée par le SARS-CoV-2.

Ce que les moustiques ont révélé sur l’exposition des villages

Au total, 690 moustiques ayant pris un repas sanguin ont été testés provenant de 299 ménages. Quatre espèces ont été identifiées, principalement Anopheles gambiae et Anopheles funestus, bien connues comme vecteurs du paludisme, ainsi que des effectifs plus faibles de Culex quinquefasciatus et Anopheles rufipes. Environ un moustique sur trois portait des anticorps humains détectables contre le coronavirus, avec une séroprévalence globale de 31 %. Les villages proches de Bobo-Dioulasso présentaient une séroprévalence basée sur les moustiques plus élevée que ceux proches d’Ouagadougou, reflétant des tendances déjà rapportées dans des études humaines directes. À l’échelle des villages, certaines communautés avaient presque la moitié des moustiques testés positifs, tandis que dans un village aucun moustique n’était positif. Lorsque les résultats étaient regroupés par foyer, la part des maisons avec au moins un moustique positif était encore plus élevée, car la capture d’un plus grand nombre d’insectes par habitation augmentait la probabilité de trouver des preuves d’une infection passée.

Différentes espèces de moustiques, différents indices

L’équipe a également comparé l’efficacité des différentes espèces de moustiques à capturer le signal des anticorps humains. Culex quinquefasciatus, une espèce qui se nourrit souvent sur l’homme et se repose à l’intérieur, présentait la plus forte fraction de repas sanguins positifs, tandis qu’Anopheles rufipes avait la proportion la plus faible. Les deux espèces communes d’Anopheles se situaient entre les deux. Ces contrastes suggèrent que l’écologie des moustiques et leurs habitudes alimentaires déterminent l’utilité de chaque espèce pour ce type de surveillance. Bien que les anticorps dans l’intestin d’un moustique ne restent détectables que pendant environ un jour, le moment des collectes, tôt le matin, correspondait probablement à des piqûres nocturnes récentes, ce qui a aidé à préserver le signal.

Ce que cela signifie pour la surveillance sanitaire rurale

L’étude montre que l’analyse du sang de moustiques naturellement nourris peut révéler où le coronavirus a circulé, même dans des lieux où les tests formels sont rares. Parce que la méthode évite de prélever du sang directement sur les personnes, elle peut être moins coûteuse, moins invasive et plus facile à organiser que de larges enquêtes sérologiques, en particulier dans les régions reculées. Bien que les résultats ne puissent pas fournir des taux d’infection exacts, ils offrent une estimation minimale utile et mettent en évidence les différences entre communautés. À l’avenir, combiner l’analyse du sang de moustiques avec des outils permettant d’identifier les hôtes piqués pourrait aider à suivre l’exposition humaine et animale à une gamme d’agents pathogènes, offrant une manière pragmatique de surveiller les maladies nouvelles et connues à la périphérie du système de santé.

Citation: de Souza, R.M., Bilgo, E., Gnambani, E.J. et al. Seroprevalence of SARS-CoV-2 in rural communities of Burkina faso (West Africa) assessed through blood-fed mosquitoes. Sci Rep 16, 15816 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-46133-5

Mots-clés: SARS-CoV-2, surveillance COVID-19, Burkina Faso rural, échantillonnage de moustiques, xénosurveillance