2025 Sierra Leone mpox salgınının genomik epidemiyolojisi

Bu salgın neden herkes için önemli

2025 başında Sierra Leone, Afrika'ya yayılan ve vakaları Avrupa ile Amerika Birleşik Devletleri'ne kadar götüren bir mpox dalgasının merkezi haline geldi. Bir zamanlar daha çok vahşi hayvan temasıyla ilişkilendirilen nadir bir enfeksiyon olarak görülen mpox, artık insanlardan insanlara öyle biçimlerde yayılıyor ki sağlık sistemlerini hızla zorlayabiliyor. Bu çalışma, bilim insanlarının virüs genomlarını —esasen patojenin genetik parmak izlerini— vaka verileriyle birleştirerek salgının nasıl başladığını, nerelere yayıldığını ve neden erken uyarı sistemlerinin bu kadar çok enfeksiyonu kaçırdığını nasıl geriye doğru izlediklerini gösteriyor.

Sessiz bir kıvılcımın nasıl ulusal bir yangına dönüştüğü

Araştırmacılar, Ocak–Ağustos 2025 arasında Sierra Leone'nin 14 bölgesinden toplanan 338 mpox virüs örneğinin dizilimini yaptı. Bu genomları Batı Afrika ve ötesinden binlerce diğer örnekle karşılaştırarak neredeyse tamamının G.1 adını verdikleri tek bir yeni dalga ait olduğunu buldular. Bu dal, nihayetinde 2014’ten beri Nijerya’da dolaşan ve önceki uluslararası salgınları besleyen virüslere dayanıyor. Genetik ipuçları G.1’in 2024 sonbaharının sonlarına doğru, yani Sierra Leone'nin ilk vakasını doğrulamasından aylar önce yayılmaya başladığını gösteriyor; bu da salgının insanların birbirini zaten enfekte ettiği uzun bir “gizli” evresi olduğunu gösteriyor.

Virüsün yoğun bir başkentte nasıl hızla yayıldığı

Açık bulgulardan biri, yoğun nüfuslu başkent bölgesi Western Area Urban’ın salgının ana itici gücü olarak hareket etmesi. Ekip, virüs genomlarının zamanlaması ve benzerliğini kullanarak enfeksiyonların bölgeden bölgeye nasıl hareket ettiğini yeniden yapılandırdı. Modelleri Western Area Urban’ın ülkenin geri kalanının çoğunu tohumladığını, Port Loko, Kenema ve Bo gibi yerlere tekrarlayan enfeksiyon dalgaları gönderdiğini gösteriyor. Bu bölgelerde yerleştiğinde, yerel bulaş zincirleri özellikle test ve izolasyon başlangıçta yeterince yaygınlaşmadığında aylarca sürebiliyordu. Bu örüntü, yüksek bağlantılı bir şehre yapılan tek bir girişin nasıl geniş kapsamlı bir salgını tetikleyebileceğini yansıtıyor.

Virüsün mutasyonları yayılma hakkında ne anlatıyor

Çalışma ayrıca virüste bulunan genetik değişiklik türlerini yakından inceledi. G.1’deki birçok mutasyon, viral DNA üzerinde belirgin bir iz bırakan insan savunma proteini APOBEC3 tarafından oluşturulan bir paterne uyuyor. Bu değişikliklerin yoğun birikimi, virüsün hayvanlardan ara sıra atlamak yerine tekrar tekrar insanlardan insana geçtiğinin bir işareti. Buna karşılık, Gine ve Liberya’da tespit edilen ve Sierra Leone’de de bir vakayı içeren daha küçük, daha eski bir mpox virüs kümesi bu değişikliklerden çok daha az gösteriyor; bu da sürdürülen insan içi yayılma yerine zaman zaman hayvandan insana sıçramalara işaret ediyor. Birlikte bu sinyaller, 2025 krizinin insanlardan insanlara devam eden bulaşma tarafından sürüklendiğini doğruluyor.

Gizli enfeksiyonlar ve kontrol çabalarının rolü

İstatistiksel modellerle ve dizileme verileriyle birleştirerek, araştırmacılar enfeksiyonların yalnızca yaklaşık üçte birinin genomunun dizilendiğini ve resmi vaka sayıların ülke genelindeki mpox vakalarının kabaca yarısını kaçırmış olabileceğini tahmin ettiler. Erken dönemde enfeksiyon sayısının yaklaşık her üç haftada bir ikiye katlandığını hesapladılar; bu, bildirilen vakalardaki dik artışla uyumluydu. 2025’in ilerleyen dönemlerinde aşı kampanyaları genişledikçe, vaka izolasyonu sıkılaştıkça ve temas takibi iyileştikçe, yerel bulaş zincirlerinin sayısı ve uzunluğu keskin biçimde azaldı. Salgın daha sonra bazı komşu ülkelerde olduğu gibi yavaş, kalıcı dolaşıma yerleşmek yerine geriledi; komşu ülkelerde hayvan rezervuarlarının virüsü yeniden tanıtması sürükleyici olmuştu.

Gelecek salgınlar için bunun anlamı

Konunun uzmanı olmayanlar için temel mesaj, virüs genomlarıyla salgınları izlemenin bir krizin ne zaman başladığını, gerçekte ne kadar büyük olduğunu ve hangi yerlerin sessizce yayılmayı körüklediğini ortaya çıkarabileceğidir. Sierra Leone mpox salgınında, yeni insan- insana geçen bir soy, ülke çapında patlamadan ve vakaları yurt dışına göndermeden önce aylar boyunca kalabalık bir başkentte fark edilmeden sönüyordu. Dünya dikkatini verdiğinde binlerce insan zaten enfekte olmuştu. Yazarlar, yerel laboratuvar kapasitesinin güçlendirilmesini, teste ve aşılara hızlı ve adil erişimin genişletilmesini ve genetik verilerin saha gözetimiyle bağlanmasının, ülkelerin benzer kıvılcımları yeterince erken tespit edip bir sonraki ülke çapındaki alevlenmeyi önleyebilmeleri için gerekli adımlar olduğunu savunuyorlar.

Atıf: Campbell, A.K.O., Sandi, J.D., Omah, I.F. et al. Genomic epidemiology of the 2025 mpox epidemic in Sierra Leone. Nat Med 32, 1917–1926 (2026). https://doi.org/10.1038/s41591-026-04385-8

Anahtar kelimeler: mpox, Sierra Leone salgını, genomik gözetim, virüs bulaşması, kamu sağlığı müdahalesi