Des isolats endophytes de Trichoderma et Bacillus suppriment la chancrosité associée à Lasiodiplodia theobromae chez le bleuet dans des conditions côtières arides

Pourquoi cela importe pour les amateurs de bleuets

Les bleuets sont célébrés comme un superfruit santé et sont devenus une culture d’exportation clé pour le Pérou. Pourtant, dans les vallées côtières arides du pays, de nombreux arbustes dépérissent lentement à cause d’un problème caché dans leur bois. Cette étude examine quels champignons attaquent les tiges de bleuet dans le nord du Pérou et teste si des microbes bienfaisants vivant à l’intérieur des plantes peuvent aider à les défendre, ouvrant la voie à des moyens plus sûrs de protéger la production sans se reposer uniquement sur les pulvérisations chimiques.

Une maladie cachée à l’intérieur du bois du bleuet

Les chercheurs ont travaillé dans trois grandes exploitations commerciales de bleuets de la zone Nuevo Proyecto–Olmos, couvrant 176 hectares. Ils ont parcouru les champs en zigzag, inspectant les plants pour repérer les pousses mortes, les tiges brunes et la perte de feuilles, signes classiques d’une maladie appelée dépérissement (dieback) ou brûlure des tiges. En moyenne, 7 % des plants étaient affectés, soit l’équivalent de plus de 61 000 arbustes, certaines variétés comme Emerald et Snowchaser montrant des niveaux de dégâts plus élevés. Parce que les maladies du bois ont tendance à s’accumuler sur plusieurs années, même ces chiffres modérés constituent un signal d’alarme précoce pour la productivité à long terme.

À la recherche des principaux coupables

Pour déterminer quels organismes étaient responsables, l’équipe a collecté 54 échantillons de tiges provenant de plants malades et les a apportés au laboratoire. Après désinfection de la surface des morceaux de bois, ils ont mis en culture les champignons présents sur des boîtes de culture, examiné leur morphologie au microscope et confirmé leur identité par analyse de l’ADN. Des champignons ont été trouvés dans chaque échantillon malade. Un groupe nommé Lasiodiplodia dominait, apparaissant dans les deux tiers des cas, tandis que Neopestalotiopsis, Fusarium et Diaporthe étaient moins fréquents. Lorsque de jeunes plants sains ont été délibérément blessés et inoculés avec ces champignons, les espèces de Lasiodiplodia, en particulier Lasiodiplodia theobromae, ont provoqué les lésions brunes les plus longues et le dépérissement le plus sévère, prouvant qu’elles sont les principaux responsables du problème dans cette région.

Comment la chaleur et la nourriture influencent la croissance fongique

Les scientifiques ont également étudié comment l’environnement et l’apport nutritif affectent ces champignons. Ils ont cultivé sept isolats de Lasiodiplodia sur deux milieux de laboratoire standards à des températures de 20 à 35 degrés Celsius. Sur un milieu basique à base de pomme de terre, la croissance était lente et inégale à 20 °C et fortement réduite à 35 °C, tandis que 25 à 30 °C favorisaient une propagation rapide et uniforme, correspondant aux conditions chaudes et semi-arides des exploitations où la maladie prospère. Sur un milieu plus riche à base de maïs, les champignons ont poussé plus rapidement et de façon plus homogène à toutes les températures, montrant comment un bois riche en nutriments peut accélérer leur colonisation. Certains souches ont même changé de couleur sous le stress thermique, signe d’un métabolisme modifié, mais ont néanmoins réussi à couvrir les boîtes, soulignant leur adaptabilité.

Recruter des microbes utiles à l’intérieur de la plante

Plutôt que de recourir d’emblée aux fongicides, l’équipe s’est demandé si des microbes vivant naturellement à l’intérieur des tissus sains du bleuet pouvaient contre-attaquer. Ils ont isolé plusieurs souches de Trichoderma, un champignon bénéfique, et de Bacillus, une bactérie bénéfique, à partir de tiges indemnes de symptômes dans les mêmes parcelles. Dans des tests en boîte appariés, des fragments de Lasiodiplodia et ces microbes bienfaisants ont été placés dans la même boîte et laissés croître l’un vers l’autre. De nombreux isolats de Trichoderma et Bacillus ont ralenti l’expansion du pathogène de plus de 60 %. Certaines souches de Trichoderma ont même recouvert le champignon nuisible, tandis qu’un produit commercial de Bacillus subtilis et deux traitements à base de Trichoderma ont presque complètement arrêté la croissance de Lasiodiplodia sur un milieu enrichi en leurs spores.

Ce que cela signifie pour les futures exploitations de bleuets

Pris ensemble, ces résultats montrent que le dépérissement du bleuet dans le nord côtier du Pérou est principalement provoqué par des champignons Lasiodiplodia qui prospèrent dans des conditions chaudes et sèches et colonisent les tissus ligneux de la plante. En parallèle, l’étude révèle que des microbes endophytes bienfaisants, en particulier certaines souches de Trichoderma et Bacillus, peuvent fortement limiter ces champignons en conditions contrôlées. Bien qu’il s’agisse d’essais en laboratoire à un stade précoce plutôt que d’essais sur le terrain, ils fournissent une liste restreinte d’alliés biologiques prometteurs qui pourraient, après de nouveaux tests, intégrer des programmes de gestion intégrée des maladies. Pour les producteurs et les consommateurs, cela ouvre la possibilité de plants de bleuet plus sains protégés par les partenaires microscopiques de la nature, avec une dépendance réduite aux traitements chimiques.

Citation: Villanueva-Olivera, W., Valladolid-Suyón, E., Palomino, M. et al. Endophytic Trichoderma and Bacillus isolates suppress Lasiodiplodia theobromae-associated dieback in blueberry under arid coastal conditions. Sci Rep 16, 15250 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-46484-z

Mots-clés: chancrosité du bleuet, Lasiodiplodia, Trichoderma, contrôle biologique Bacillus, champignons infectant le bois