Un modèle mécanistique multi-hôtes de l’émergence et du contrôle de la peste porcine africaine en Roumanie

Pourquoi cela compte pour les agriculteurs et la sécurité alimentaire

La peste porcine africaine est une maladie mortelle des porcs qui a décimé des millions d’animaux dans le monde, menaçant les moyens de subsistance des éleveurs et faisant monter les prix du porc. La Roumanie a été l’un des pays d’Europe les plus affectés, avec des foyers touchant à la fois des cochons d’arrière-cour dans les villages et des sangliers dans les forêts environnantes. Cette étude utilise un modèle informatique détaillé pour démêler la façon dont le virus s’est propagé entre les élevages et la faune lors de la première grande vague épidémique de 2018 — et pour tester quelles mesures de contrôle pourraient réellement aider à maîtriser une telle flambée.

Deux mondes liés : cochons de village et sangliers

La campagne roumaine est parsemée de villages où de nombreux foyers gardent quelques porcs dans de simples enclos d’arrière-cour. Les forêts et champs voisins abritent des sangliers. Lorsque la peste porcine africaine est arrivée dans le sud-est de la Roumanie en 2018, des cas sont rapidement apparus dans les deux milieux. Les chercheurs ont traité chaque village comme une ferme unique de grande taille et ont divisé le paysage en parcelles hexagonales pouvant abriter des sangliers. Ils ont ensuite utilisé les rapports officiels de fermes infectées et de carcasses de sangliers de juin à décembre 2018 pour reconstruire comment la maladie a probablement sauté d’un endroit à l’autre et d’un type d’hôte à l’autre.

Construire une épidémie numérique sur la carte

L’équipe a créé un modèle « mécanistique », c’est-à-dire qu’il suit des règles simples sur la façon dont l’infection se propage : quelles fermes ou parcelles de sangliers peuvent entrer en contact, à quelle vitesse les lieux infectés sont détectés et combien de temps ils restent infectieux. Ils ont testé 256 versions différentes du modèle, en variant des hypothèses telles que si les fermes infectent principalement leurs voisins immédiats ou propagent la maladie plus largement, et si des introductions à longue distance chez les sangliers doivent être ajoutées en plus de la propagation locale. Ils n’ont ensuite conservé que les versions qui reproduisaient le mieux les courbes épidémiques réelles — combien de nouvelles fermes infectées et de parcelles de sangliers infectées apparaissaient chaque semaine dans chacun des six départements.

Qui a infecté qui ?

Une fois le modèle le mieux ajusté identifié, les chercheurs l’ont utilisé pour estimer la source la plus probable de chaque nouvelle infection. Pour les élevages porcins domestiques, ils ont calculé qu’environ trois fermes infectées sur cinq étaient liées à d’autres fermes touchées, un peu plus d’une sur quatre étaient liées à des zones de sangliers infectées, et le reste résultait d’infections provenant de l’extérieur du système modélisé, comme des mouvements à longue distance. Pour les parcelles de sangliers, la plupart des infections provenaient d’autres zones de sangliers infectées, mais une part substantielle provenait des fermes. Les parcelles boisées avec une couverture arborée suffisante ont agi comme des points chauds : ces zones étaient bien plus susceptibles à la fois de s’infecter et de transmettre l’infection que les terrains plus ouverts. Ensemble, ces schémas montrent que les deux populations d’hôtes formaient un réseau fortement connecté plutôt que deux épidémies séparées.

Tester des stratégies de contrôle hypothétiques

La Roumanie a déjà appliqué des règles de contrôle standard pendant la vague de 2018, notamment l’abattage des porcs dans les fermes détectées et la mise en place de zones de surveillance de 10 kilomètres. Le modèle a permis aux auteurs d’explorer plusieurs scénarios « et si » : enlever plus rapidement les carcasses de sangliers, améliorer la surveillance passive dans les élevages pour détecter les infections plus tôt, et des stratégies d’abattage plus agressives consistant soit à supprimer immédiatement des fermes entières, soit à abattre préventivement les fermes voisines lorsqu’un cas de sanglier est détecté à proximité. Bien que ces interventions aient eu tendance à réduire la taille médiane de l’épidémie dans les simulations, les bénéfices étaient modestes et fortement incertains, et aucune n’a montré un soutien statistique solide démontrant une supériorité claire par rapport à la réponse de base. Les réalités sociales, comme l’opposition à des abattages préventifs à grande échelle des porcs d’arrière-cour, limitent en outre ce qui peut être mis en œuvre en pratique.

Limites du modèle et des données

L’étude met également en lumière les difficultés de modéliser une maladie animale en conditions réelles. La surveillance des sangliers était incomplète et a probablement manqué de nombreux cas, en particulier dans les zones reculées. Au sein des villages, les informations sur le nombre de foyers gardant des porcs ou sur leurs interactions étaient limitées, si bien que chaque village a dû être traité comme une unité unique. Au début de l’épidémie, les efforts de détection ont pu s’intensifier rapidement, mais le modèle a supposé un niveau constant de surveillance. Ces lacunes signifient que, si les tendances générales sont robustes — en particulier l’importance des transmissions entre espèces —, les pourcentages précis sont entourés de larges marges d’incertitude.

Ce que cela signifie pour les futures flambées

Pour les non-spécialistes, la conclusion clé est que contrôler la peste porcine africaine dans des contextes comme la Roumanie ne peut pas se concentrer uniquement sur les élevages ou uniquement sur la faune. Les porcs d’arrière-cour et les sangliers se réinfectent continuellement, en particulier dans et autour des zones boisées. Le modèle suggère que même des versions relativement vigoureuses des stratégies actuelles sont peu susceptibles d’éradiquer le virus à moins d’intégrer une réflexion plus large incluant les deux hôtes, une meilleure surveillance de la faune et une prise en compte réaliste des aspects culturels et économiques locaux. Plutôt que de promettre une éradication rapide, les autorités devront peut-être envisager une gestion à long terme d’une circulation à bas niveau chez les sangliers, tout en renforçant la biosécurité et la surveillance pour éviter les retours du virus vers les élevages domestiques.

Citation: Hayes, B., Vergne, T., Rose, N. et al. A multi-host mechanistic model of African swine fever emergence and control in Romania. Nat Commun 17, 2659 (2026). https://doi.org/10.1038/s41467-026-70769-6

Mots-clés: Peste porcine africaine, Élevages porcins en Roumanie, Transmission par le sanglier, Modélisation des maladies, Contrôle des maladies animales