Cartographie métagénomique shotgun de la salive révèle des insights sur la diversité et la fonction du microbiome buccal pendant la grossesse

Pourquoi la bouche compte pendant la grossesse

La plupart des gens considèrent le brossage et le passage du fil dentaire comme des moyens de protéger leurs propres dents et gencives. Cette étude suggère que le mélange de minuscules organismes vivant dans la salive peut aussi évoluer pendant la grossesse d’une façon susceptible d’avoir des conséquences pour la mère et le bébé. En examinant de près ces microbes chez des femmes enceintes et non enceintes, les chercheurs ont exploré comment la grossesse pourrait pousser la cavité buccale vers un état plus favorable à l’inflammation.

Le monde caché dans la salive

Nos bouches abritent des centaines d’espèces bactériennes qui vivent généralement en équilibre et contribuent à stabiliser l’environnement buccal. Dans cette étude, les scientifiques ont prélevé de la salive auprès de 71 femmes en fin de grossesse et de 143 femmes non enceintes ayant des cycles menstruels réguliers. Chaque participante non enceinte a fourni des échantillons lors de trois phases différentes de son cycle afin de tenir compte des variations hormonales normales. À l’aide d’une méthode puissante basée sur l’ADN appelée métagénomique shotgun, l’équipe a cartographié les microbes présents et les types d’activités auxquels ils étaient susceptibles de participer.

Comparer les bouches des femmes enceintes et non enceintes

Les chercheurs ont identifié un riche ensemble de caractères microbiens : 10 grandes lignées, plus de 100 genres et plus de 400 espèces au total. Pourtant, le tableau global différait entre les groupes. Les femmes enceintes présentaient moins d’espèces distinctes dans leur salive, même si les espèces restantes étaient présentes à des proportions similaires les unes par rapport aux autres. Autrement dit, la diversité et la richesse étaient réduites pendant la grossesse, tandis que l’équitabilité de la communauté restait à peu près la même. Ces différences ont persisté après que l’équipe a ajusté soigneusement les résultats en tenant compte de l’âge, de l’indice de masse corporelle, du temps de jeûne avant le prélèvement, des voyages récents et des visites dentaires.

Bascules vers des bactéries plus risquées

Au-delà des simples comptages, la composition de la communauté a évolué de façon importante. Un schéma classique de regroupement des microbes buccaux met en évidence des clusters associés soit à la santé gingivale, soit à la maladie gingivale. Chez les femmes enceintes, les bactéries du soi‑disant complexe rouge, fortement liées aux gencives enflammées, étaient plus abondantes. Parallèlement, certains groupes habituellement associés à une bouche plus saine étaient moins fréquents. L’équipe a également utilisé une méthode distincte pour mesurer directement plusieurs bactéries buccales bien connues. Ils ont confirmé des niveaux plus élevés de Porphyromonas gingivalis, une espèce clé de la maladie gingivale, chez les femmes enceintes, tandis que d’autres espèces, comme Fusobacterium nucleatum, étaient en réalité moins abondantes, montrant que la grossesse n’augmente pas simplement tous les microbes nuisibles simultanément.

Changements dans les capacités fonctionnelles des microbes

L’étude ne s’est pas arrêtée à la présence des espèces ; elle a aussi examiné ce que ces microbes pourraient être capables de faire. En analysant les voies génétiques, les chercheurs ont identifié 40 modules fonctionnels qui différaient entre les femmes enceintes et non enceintes. Nombre d’entre eux impliquaient la dégradation de molécules étrangères, y compris des substances liées à des polluants courants et à des expositions liées au mode de vie. Certaines voies étaient plus fréquentes pendant la grossesse, tandis que d’autres étaient réduites, ce qui laisse entendre que la machinerie microbienne de la bouche est reconfigurée durant cette période de la vie. Ces motifs sont demeurés même après exclusion des femmes qui fumaient, utilisaient du snus ou du cannabis, consommaient de l’alcool de manière importante, prenaient récemment des antibiotiques ou souffraient de certaines maladies chroniques.

Ce que cela pourrait signifier pour les mères et les bébés

Bien que cette recherche ne puisse pas établir de relation de cause à effet, elle montre clairement qu’une grossesse à terme est associée à un microbiome buccal moins diversifié et plus enclin à l’inflammation. Parce que certaines bactéries buccales ont été liées dans des travaux antérieurs à des naissances prématurées, à des pertes de grossesse et à l’inflammation placentaire, de tels changements pourraient avoir des implications sanitaires plus larges. Les résultats soutiennent l’idée que prêter attention aux soins bucco‑dentaires avant et pendant la grossesse pourrait aider à maintenir cette communauté microbienne dans un état plus équilibré, et ils soulignent la nécessité d’études futures pour tester comment ces modifications buccales peuvent influencer les résultats pour les femmes enceintes et leurs nouveau‑nés.

Citation: Bostanci, N., Antony, A.T., Silbereisen, A. et al. Shotgun metagenomic mapping of saliva reveals insights into diversity and function of the oral microbiome in pregnancy. Sci Rep 16, 16450 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-54100-3

Mots-clés: microbiome buccal, grossesse, bactéries de la salive, santé des gencives, diversité microbienne