Clear Sky Science · zh

从蚂蚁分离得到的Nocardia anocheti sp. nov.和Streptomyces odontomachicola sp. nov.的分类学描述

· 返回目录

微小盟友,巨大的药物潜力

大多数人把蚂蚁视为野餐掠食者或园艺害虫,但这些昆虫体内外也寄居着可能对抗危险感染的微观伙伴。本研究考察了泰国蚂蚁体表与体内的细菌,发现了两种此前未知的物种,其基因组显示出合成有用生物活性化合物的潜能。通过追踪这些细菌在蚂蚁体表或体内的分布、与已知近缘的差异以及基因组所含信息,研究者为自然界隐藏的“药房”打开了一扇新窗。

Figure 1
Figure 1.

蚂蚁:活体微生物养殖场

蚂蚁并非独自生活:许多蚂蚁在体表或微小的体腔位点携带专化细菌。这些细菌常产生天然抗生素,保护蚁群免受有害真菌和其他病原体侵袭。科学家们已在蚂蚁身上发现若干此类有益菌株,其中包括能产生对耐药医院病原体有效分子的细菌。然而在生物多样性丰富的国家如泰国,蚂蚁的细菌伙伴仍未被充分记录。作者着手通过从泰国乡间及国家科学博物馆采集的两种蚂蚁中分离放线菌——这一以产抗生素著称的细菌类群——来探索这一被忽视的世界。

发现两种新的细菌邻居

研究团队从陷阱颚蚁Anochetus graeffei和牙颚蚂蚁Odontomachus simillimus的工蚁中分离出两株有前景的菌株,命名为AG03ᵀ和ODS28ᵀ。对其遗传特征、生长模式和化学成分的细致比较显示,两株均不属于任何已知物种。对标准标记基因(16S rRNA)及更广泛的多基因比对将AG03ᵀ归入Nocardia属,将ODS28ᵀ归入Streptomyces属,但它们各自位于系统发育树的独立分支。整体基因组相似性指标——平均核苷酸身份(ANI)和数字DNA–DNA杂交(dDDH)——远低于划归现有物种的公认阈值。以上多重证据使作者将这两株命名为两个新物种:Nocardia anocheti sp. nov.和Streptomyces odontomachicola sp. nov.,并分别与其蚁宿主关联。

颜色、形态与化学中的线索

研究者并不单靠DNA判断。他们还在不同培养条件下培养这些菌株,记录其外观、偏好温度、耐盐性和营养来源。Nocardia anocheti形成带有橙黄色底色和细致空中丝的粉红色菌落,生长适温为25至37°C,能耐受中等盐度。它能利用某些常见糖,但不能分解其他近缘种可利用的糖。Streptomyces odontomachicola则形成黄色到橙色菌落,能够耐受更高的盐浓度,并对不同糖类表现出更广的利用谱。显微观察下,两者行为类似典型的丝状放线菌,但其详细的化学指纹——例如所含脂肪酸、细胞壁构件和类似维生素的醌类——又将它们与近缘种区分开来,进一步支持其为新物种的结论。

基因组中蕴藏的化学创新

或许最令人兴奋的发现来自细菌的基因组。当团队用专门软件扫描其DNA时,发现了多个生物合成基因簇——一段段协同工作以合成复杂天然产物的基因。在Nocardia anocheti中,这些基因簇提示可能合成如ε‑聚‑L‑赖氨酸、金属螯合作用分子以及一种名为ectoine的渗透保护剂等化合物。Streptomyces odontomachicola则携带更为丰富的基因库,包括合成泥土香味萜类以及若干类似已知抗生素和铁螯合分子的途径。尽管这些基因簇代表的是预测潜力而非已证实的产物,但它们表明蚂蚁体内寄居的细菌可能合成尚待检验的多样化化学物质。

Figure 2
Figure 2.

对未来药物的意义

通俗地说,这项工作表明看似普通的蚂蚁也能携带非凡的微生物。通过发现与蚁宿主密切相关的两种新细菌,并展示其基因组中包含许多合成复杂天然分子的蓝图,研究强化了昆虫相关细菌是药物发现富饶土壤的观点。尽管还需进一步实验来确认这些微生物实际能产生哪些化合物及其效力,但这些发现将泰国的蚂蚁群落列入日益增长的天然宝库名单中,可能为下一代抗生素和其他有价值药物的发现提供来源。

引用: Somphong, A., Tunvongvinis, T., Suriyachadkun, C. et al. Taxonomic descriptions of Nocardia anocheti sp. nov. and Streptomyces odontomachicola sp. nov. isolated from ants. Sci Rep 16, 13074 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-43878-x

关键词: 蚂蚁微生物组, 放线菌, 天然抗生素, Nocardia属, Streptomyces属