Genómica comparativa y potencial de biocontrol de cinco cepas de Bacillus aisladas del rizosfera de la vid

Por qué esto importa a los amantes del vino y a los viticultores

Las vides de todo el mundo están bajo asedio por el moho gris, un hongo destructivo que puede arruinar las cosechas y deteriorar el sabor, el color y el aroma del vino. Hoy, esta enfermedad se controla principalmente con fungicidas sintéticos que pueden dejar residuos tanto en los viñedos como en las botellas. Este estudio explora una alternativa más ecológica: bacterias del suelo presentes de forma natural en viñedos argentinos que podrían proteger las vides de las enfermedades manteniendo los productos químicos fuera de la copa.

Una comunidad oculta alrededor de las raíces de la vid

Las vides no viven solas. Sus raíces están rodeadas por una activa comunidad subterránea de microbios que se alimentan de exudados radiculares y, a cambio, pueden ayudar a las plantas a hacer frente al estrés y a las enfermedades. A partir de esta zona radical, los investigadores habían aislado previamente cinco cepas de Bacillus, un grupo de bacterias resistentes y formadoras de esporas ya utilizadas en algunos tratamientos agrícolas ecológicos. Las cinco cepas pudieron frenar en pruebas de laboratorio importantes patógenos fúngicos, incluido Botrytis cinerea, causante del moho gris, pero su identidad exacta y sus mecanismos de acción seguían sin estar claros.

Distinguiendo a las benéficas de las cuestionables

Para entender lo que habían encontrado, el equipo secuenció el ADN completo de cada cepa de Bacillus y comparó los genomas con bases de datos de referencia. Dos cepas, llamadas AMCV2 y FAU18, se agruparon claramente con Bacillus subtilis, una especie ampliamente considerada segura y ya utilizada como agente de control biológico. Las otras tres cepas se agruparon dentro de la familia Bacillus cereus, que incluye no solo bioplaguicidas útiles sino también bacterias capaces de causar intoxicaciones alimentarias y otras enfermedades. Debido a que los límites dentro de esta familia son difusos, los autores combinaron múltiples métodos de clasificación y comprobaciones microscópicas, asignando finalmente estas tres a Bacillus cereus sensu stricto—un grupo que porta genes típicos de toxinas diarreicas y que, por tanto, exige precaución.

Armas naturales fabricadas por bacterias del viñedo

Los datos genómicos también revelaron qué herramientas químicas podrían usar estas bacterias para combatir hongos. Las cinco cepas portaban conjuntos de genes que pueden dirigir la producción de metabolitos secundarios—moléculas especializadas no necesarias para la supervivencia básica pero cruciales para la competencia y la defensa. En el par seguro de B. subtilis, AMCV2 y FAU18, los investigadores encontraron clústeres genéticos completos y altamente conservados para dos lipopeptidos cíclicos, fengicina y surfactina. Estas moléculas, parecidas a jabones, son conocidas por perforar membranas fúngicas y alterar biofilms. Las cepas de B. cereus, en contraste, mostraron un fuerte potencial genético para producir sideróforos, compuestos que captan hierro del entorno, pero solo indicios incompletos de los potentes lipopeptidos antifúngicos.

Poner a prueba las defensas bacterianas

Para comprobar si estas predicciones se traducían en actividad real, el equipo aisló lipopeptidos de cultivos de cada cepa y los aplicó en placas donde crecía el moho gris. Solo los extractos de AMCV2 y FAU18 crearon zonas claras y duraderas donde el hongo dejó de avanzar; las cepas de B. cereus no mostraron supresión visible en las mismas condiciones. Cuando los científicos observaron la etapa más temprana del ciclo de vida del hongo—la germinación de esporas—hallaron que los lipopeptidos del par B. subtilis bloquearon casi por completo la brotación de las esporas de moho gris, mientras que las esporas en los controles germinaron con normalidad. La combinación de los dos extractos de B. subtilis no potenció más el efecto, pero tampoco lo redujo, lo que sugiere que cada uno por sí solo ya es muy potente.

Hacia un control de enfermedades más limpio en el viñedo

Combinando el análisis del ADN con pruebas de laboratorio, este estudio delimita qué bacterias de viñedo son a la vez efectivas y probablemente seguras para usar como fungicidas vivos. El resultado clave es que dos cepas de B. subtilis de raíces de vid argentinas producen potentes lipopeptidos antifúngicos que impiden la germinación de esporas de moho gris, ofreciendo una herramienta prometedora para proteger las vides sin depender de pulverizaciones químicas intensivas. En contraste, las cepas de B. cereus, pese a producir compuestos captadores de hierro, mostraron escasa acción antifúngica directa y portan rasgos genéticos que suscitan dudas de seguridad. En conjunto, los hallazgos apuntan a AMCV2 y FAU18 como candidatas sólidas para biofungicidas basados en Bacillus de próxima generación que podrían apoyar una viticultura más sostenible y sin residuos.

Cita: Lajoinie, D.M., Rocco Welsh, R., Rey, C. et al. Comparative genomics and biocontrol potential of five Bacillus strains isolated from grapevine rhizosphere. Sci Rep 16, 10819 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-44555-9

Palabras clave: biocontrol de la vid, Bacillus subtilis, moho gris, biofungicida, viticultura sostenible