La ingesta habitual de café moldea el microbioma intestinal y modifica la fisiología y la cognición del hospedador

Por qué tu café matutino es algo más que un despertador

El café suele verse como un simple estimulante, pero este estudio muestra que la taza diaria puede estar remodelando silenciosamente tus microbios intestinales, modulando tu sistema inmune y condicionando cómo te sientes y piensas. Al comparar a personas que beben café con regularidad con quienes nunca lo hacen —y luego pedir a los bebedores que dejen de tomarlo y lo reintroduzcan como regular o descafeinado— los investigadores revelan cómo el café conecta el intestino y el cerebro de maneras que van mucho más allá de la cafeína.

Cómo siguió el estudio a aficionados y abstinentes del café

Los investigadores reclutaron adultos sanos en sus 30 y 40 años y los dividieron en dos grupos: bebedores habituales de café y personas que nunca beben café. Todos completaron diarios alimentarios detallados, cuestionarios sobre estado de ánimo y estrés, y pruebas cognitivas de memoria, atención y procesamiento emocional. También proporcionaron muestras de heces, orina, sangre y saliva para que los científicos pudieran perfilar los microbios intestinales, medir cientos de pequeñas moléculas y rastrear hormonas del estrés. A los bebedores de café se les pidió que abandonaran todo consumo de café durante dos semanas, tras lo cual se les asignó al azar a tomar café instantáneo con o sin cafeína durante tres semanas, repitiéndose las recogidas de muestras y las pruebas a lo largo del tiempo.

Qué hizo el café en el estado de ánimo, el comportamiento y el pensamiento

Al inicio, los bebedores habituales reportaron tendencias hacia mayor impulsividad y reacciones emocionales más intensas que los no bebedores, aunque sus puntuaciones de estrés, depresión y ansiedad eran por lo demás similares. Cuando estos bebedores dejaron el café durante dos semanas, se mostraron menos impulsivos y menos reactivos emocionalmente, y algunos aspectos de la atención mejoraron —probablemente favorecidos por las pruebas repetidas pero también por la retirada del estímulo diario. Reintroducir el café en cualquiera de las dos formas redujo aún más la impulsividad y disminuyó la percepción de estrés y depresión. El café con cafeína alivió especialmente la ansiedad y el malestar psicológico y apoyó la atención, mientras que el descafeinado se asoció con mejor sueño, más actividad física y mejoras en la memoria, lo que sugiere que componentes no vinculados a la cafeína del café pueden beneficiar la cognición.

Cómo el café reconfiguró microbios intestinales y mensajeros químicos

Los contenidos intestinales de los bebedores de café mostraron huellas químicas claras del consumo. Las heces y la orina de estos participantes contenían niveles más altos de productos de degradación de la cafeína y compuestos fenólicos de origen vegetal, muchos de los cuales son procesados por bacterias intestinales. Algunas moléculas neuroactivas producidas o modificadas en el intestino —como el ácido indol‑3‑propiónico y el mensajero calmante GABA— estaban más bajas en los bebedores de café, y sus niveles cambiaron nuevamente cuando el café se retiró y se reintrodujo. El café también ajustó la abundancia relativa de cepas bacterianas específicas en lugar de transformar la diversidad global. Especies como Cryptobacterium y Eggerthella fueron más comunes en los bebedores de café, mientras que especies de Veillonella aumentaron solo después de volver a introducir el café, independientemente de la cafeína. Estos cambios dirigidos sugieren que microbios concretos son especialmente sensibles a la mezcla compleja de fibras y compuestos vegetales del café.

Efectos en todo el cuerpo sobre inmunidad, estrés y circulación

Más allá del intestino, el café alteró sutilmente señales inmunitarias e inflamatorias en la sangre. Los bebedores habituales empezaron con niveles más bajos de proteína C reactiva, un marcador general de inflamación, y niveles más altos de una molécula antiinflamatoria llamada IL‑10. Cuando abandonaron el café, marcadores inflamatorios como la PCR y el TNF‑alfa aumentaron, y las células inmunitarias produjeron más de ciertas citocinas cuando se estimularon en el laboratorio. Volver a introducir el café ajustó estos marcadores en distintas direcciones según si contenía cafeína, lo que sugiere que tanto la cafeína como otros componentes del café contribuyen a afinar la respuesta inmune. Sorprendentemente, ni el consumo habitual de café ni su retirada tuvieron un gran efecto sobre la hormona del estrés cortisol, ni al despertar ni durante una prueba estándar de estrés con agua fría, lo que implica que los beneficios del café sobre el estado de ánimo operan principalmente por otras vías biológicas.

Qué significa esto para las elecciones cotidianas sobre el café

En conjunto, los hallazgos presentan al café como una señal dietética que el microbioma intestinal puede «leer» y traducir en cambios en metabolitos, inflamación y, de forma indirecta, en el estado de ánimo y la cognición. El café con y sin cafeína aportó ventajas distintas: el café con cafeína redujo con mayor claridad la ansiedad y la presión arterial, mientras que el descafeinado favoreció el sueño y la memoria; sin embargo, ambos mejoraron el estado de ánimo y redujeron la inflamación en términos generales. Para quienes no beben café, el estudio sugiere también que puede haber ventajas en evitar la dependencia de un estimulante, como una presión arterial más estable y menos efectos de abstinencia. En última instancia, el trabajo subraya que tu hábito de café y tus microbios intestinales están íntimamente entrelazados, y que ajustar el tipo y la cantidad de café podría algún día formar parte de estrategias personalizadas para apoyar la salud cerebral y corporal.

Cita: Boscaini, S., Bastiaanssen, T.F.S., Moloney, G.M. et al. Habitual coffee intake shapes the gut microbiome and modifies host physiology and cognition. Nat Commun 17, 3439 (2026). https://doi.org/10.1038/s41467-026-71264-8

Palabras clave: café y microbioma intestinal, eje microbiota intestino‑cerebro, cafeína y cognición, dieta y salud mental, café e inflamación