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在健康的巴勒斯坦队列中通过下一代测序检测口腔HPV及分型:试点研究

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为什么口腔中的微生物很重要

大多数人都听说过人乳头瘤病毒(HPV),因为它与宫颈癌有关,但很少有人知道HPV也能感染口腔和咽喉并促成某些头颈部癌症。本研究在巴勒斯坦开展,聚焦健康成年人口腔中的HPV。研究者使用最先进的DNA测序技术,想要了解存在哪些HPV类型、它们的流行程度,以及这种高端方法是否能在目前没有HPV疫苗或筛查项目的本地诊所中可靠运行。

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寻找潜伏的病毒

HPV是一个非常常见的病毒家族,已知超过200种类型。有些类型主要引起无害的疣,而另一些被认为是“高危型”,因为它们随着时间推移可能促发宫颈癌、肛门癌或口腔咽喉癌。口腔HPV感染通常无明显症状,且可在体内隐匿多年,尤其在吸烟者或免疫功能低下者中更常见。在欧洲和北美,大约5–7%的健康人群口腔携带HPV,但来自巴勒斯坦的数据几乎为空白。缺乏这些基础信息,使得卫生主管部门难以规划疫苗接种、设计筛查项目,或评估本地HPV问题的严重程度。

采集颊拭子,而非抽血

为填补这一空白,研究团队招募了75名在西岸中部拉马拉和伯利恒市牙科诊所就诊的成年人。所有受试者年龄均在18岁以上,且报告无重大疾病或癌症病史。牙医用无菌拭子轻擦内颊、舌面和口底以采集细胞。每位参与者还填写了一份关于年龄、性别、吸烟情况以及HPV认知与疫苗接种情况的匿名简短问卷。本研究刻意规模较小,设计为“试点”研究——其主要目的是测试一种复杂的实验室方法能否可靠地在该人群的口腔样本中检测并鉴定HPV,而非提供最终的全国性统计数据。

把颊细胞变成基因线索

回到实验室后,研究者从拭子中提取DNA,并使用称为嵌套PCR的两步扩增过程,聚焦于病毒基因组中的一个特定片段——L1基因。该区域类似指纹,可以区分不同的HPV类型。随后他们将扩增产物制备用于下一代测序(NGS),这是一种能够并行读取数百万短DNA片段的高通量技术。研究团队使用开源软件清理原始数据,筛选与HPV目标匹配的序列读取,并将这些序列与国际数据库比对,以精确确定存在的HPV类型。为降低来自微量外源DNA引发的误报风险,他们仅在某一HPV类型的序列读取数至少达到100条且高度相似时,才将样本判定为阳性。

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在健康口腔中发现了什么

在75名受试者中,有5人显示明确的口腔HPV感染证据,对应的阳性率为6.7%,与美国和伊朗的报道相近。检测到三种不同的HPV类型:两人感染HPV‑18,另两人感染HPV‑31,一人感染HPV‑38。值得注意的是,与全球头颈癌关联最强的HPV‑16在这些样本中未被检测到。所发现的类型中包括两种闻名的高危型(HPV‑18和HPV‑31)以及一种较少为人熟知的类型HPV‑38,后者已与某些皮肤和口腔病变相关。通过基因比对工具,巴勒斯坦的病毒序列与来自其他国家的参考株密切聚类,证实了分型的准确性。由于只有五例阳性,研究无法可靠地将HPV感染与年龄、性别、吸烟或其他生活方式因素联系起来,而且大多数感染者甚至从未听说过HPV。

早期信号及其意义

这项小规模研究不能确切说明巴勒斯坦口腔HPV的总体流行率,但它表明高危HPV类型存在于表面健康成年人的口腔中,并且先进的DNA测序可以成功应用于本地样本。HPV‑38的出现(当前疫苗并不覆盖该类型)以及在这组小样本中未检出HPV‑16,提示口腔中的HPV类型组成可能与宫颈或其他国家有所不同。对普通读者而言,主要信息是HPV不仅仅是宫颈问题:它也能悄然感染口腔,而现代工具现在可以更精确地追踪这些感染。更大规模的全国性研究可在此试点工作基础上展开,为疫苗政策、公众意识提升提供依据,最终有助于预防未来与HPV相关的头颈部癌症。

引用: Safi, B., Khalid, M. & Nasereddin, A. Oral HPV detection and genotyping by next-generation sequencing in a healthy Palestinian cohort: pilot study. Sci Rep 16, 7282 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-37318-z

关键词: 口腔HPV, 头颈癌, 巴勒斯坦, HPV分型, 下一代测序