Oral HPV-detektion och genotypning med nästa generations sekvensering i en frisk palestinsk kohort: pilotstudie

Varför bakterierna och virusen i din mun spelar roll

De flesta har hört talas om humant papillomvirus (HPV) på grund av dess koppling till livmoderhalscancer, men betydligt färre vet att HPV också kan infektera munnen och halsen och bidra till vissa huvud- och halscancerformer. Denna studie, utförd i Palestina, granskade HPV i munnen hos friska vuxna. Genom att använda avancerad DNA-avläsningsteknik ville forskarna se vilka HPV-typer som fanns, hur vanliga de var och om en högteknologisk metod skulle fungera pålitligt i lokala kliniker som i nuläget saknar HPV-vaccinations- eller screeningsprogram.

Letar efter ett dolt virus

HPV är en mycket vanlig virusfamilj med mer än 200 kända typer. Vissa typer orsakar främst ofarliga vårtor, medan andra betraktas som "högrisk" eftersom de med tiden kan bidra till utveckling av cancer i livmoderhalsen, anus eller i munnen och halsen. Orala HPV-infektioner ger ofta inga symtom och kan tyst kvarstå i flera år, särskilt hos personer som röker eller har försvagat immunsystem. I Europa och Nordamerika har ungefär 5–7% av friska personer HPV i munnen, men det har funnits nästan ingen data från Palestina. Utan denna grundläggande information är det svårt för hälsomyndigheter att planera vaccinationskampanjer, utforma screeningsprogram eller ens bedöma hur stort ett lokalt HPV-problem kan vara.

Samla kindpinnar, inte blodprov

För att börja fylla detta gap rekryterade teamet 75 vuxna som besökte tandkliniker i centrala Västra stranden, i städerna Ramallah och Betlehem. Alla var över 18 år och uppgav inga större sjukdomar eller tidigare cancer. Tandläkare gnuggade försiktigt sterila bomullspinnar längs innerkinderna, tungan och munbotten för att samla celler. Varje deltagare svarade också på en kort anonym enkät om ålder, kön, rökning samt grundläggande kunskap om HPV och vaccinationsstatus. Studien var medvetet liten och utformad som en pilot — dess huvudsyfte var att testa om en avancerad laboratoriemetod kunde pålitligt hitta och identifiera HPV i orala prover från denna population, inte att ge slutgiltig nationell statistik.

Förvandla kindceller till genetiska ledtrådar

På laboratoriet extraherade forskarna DNA från pinnarna och använde en tvåstegsamplifieringsprocess, känd som nested PCR, för att fokusera på en viss del av virusets genetiska material kallad L1-genen. Denna region fungerar som ett fingeravtryck som skiljer en HPV-typ från en annan. De förberedde sedan det amplifierade DNA:t för nästa generations sekvensering (NGS), en höggenomströmningsmetod som läser miljontals korta DNA-fragment parallellt. Med hjälp av fritt tillgänglig onlineprogramvara rensade teamet rådata, plockade ut läsningar som matchade deras HPV-mål och jämförde dessa sekvenser med internationella databaser för att exakt bestämma vilka HPV-typer som fanns. För att minska risken för falska utslag från små mängder främmande DNA betraktade de ett prov som verkligt positivt endast om det innehöll minst 100 nästan identiska sekvensläsningar för en given HPV-typ.

Vad de fann i friska munnar

Av de 75 personer som testades hade 5 tydlig förekomst av oral HPV-infektion, motsvarande en prevalens på 6,7%, vilket är liknande rapporter från USA och Iran. Tre olika HPV-typer identifierades: HPV‑18 hos två personer, HPV‑31 hos två personer och HPV‑38 hos en person. Anmärkningsvärt nog upptäcktes inte HPV‑16 — den typ som starkast kopplas till huvud- och halscancer globalt — i något av proverna. De typer som hittades inkluderar två välkända högriskstammar (HPV‑18 och HPV‑31) och en mindre bekant typ, HPV‑38, som har kopplats till vissa hud- och orala lesioner. Genom genetiska jämförelseverktyg grupperade de palestinska virussekvenserna sig nära referensstammar från andra länder, vilket bekräftar att typningen var korrekt. Eftersom endast fem personer testade positivt kunde studien inte på ett tillförlitligt sätt koppla HPV-infektion till ålder, kön, rökning eller andra livsstilsfaktorer, och de flesta infekterade deltagarna hade aldrig hört talas om HPV.

Tidiga signaler och vad de betyder

Denna lilla studie kan inte säga exakt hur vanligt oralt HPV verkligen är i hela Palestina, men den visar att högrisk-HPV-typer finns i munnen hos annars friska vuxna och att avancerad DNA-sekvensering framgångsrikt kan användas på lokala prover. Förekomsten av HPV‑38, som inte täcks av nuvarande vacciner, och avsaknaden av HPV‑16 i denna lilla grupp antyder att sammansättningen av HPV-typer i munnen kan skilja sig från den som ses i livmoderhalsen eller i andra länder. För allmänheten är huvudbudskapet att HPV inte bara är ett livmoderhalsproblem: det kan tyst infektera munnen också, och moderna verktyg gör det nu möjligt att spåra dessa infektioner mer exakt. Större, nationella studier kan bygga vidare på detta pilotarbete för att vägleda vaccinationspolicyer, höja allmänhetens medvetenhet och i slutändan hjälpa till att förebygga framtida HPV-relaterade huvud- och halscancerformer.

Citering: Safi, B., Khalid, M. & Nasereddin, A. Oral HPV detection and genotyping by next-generation sequencing in a healthy Palestinian cohort: pilot study. Sci Rep 16, 7282 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-37318-z

Nyckelord: oral HPV, huvud- och halscancer, Palestina, HPV-genotypning, nästa generations sekvensering