Kost och miljöfaktorer styr tillsammans tarmmikrobiomet, resistomet och virulomet hos stadslivande fladdermöss

Varför stadens fladdermöss betyder något för människors hälsa

När städer växer bor människor närmare vilda djur än någonsin tidigare. Bland våra mest förbisedd grannar finns fladdermöss som vilar under broar och i byggnader. Dessa djur korsar stads- och landsbygdshimlar varje natt och äter insekter som kan bära spår av jordbruksbekämpningsmedel och antibiotika. Denna studie ställer en angelägen fråga: hur formar stadslivet och kosten fladdermössens tarmmikrober — och de gener som kan göra bakterier läkemedelsresistenta eller mer skadliga — och vad kan det innebära för folkhälsan?

Vad forskarna ville undersöka

Forskare i nordöstra Kina fokuserade på den asiatiska fläckiga fladdermusen, en art som ofta bildar stora kullkolonier på stadsbyggnader. De samlade avföringsprover från 60 fladdermöss under sen graviditet, födsel och amningsperiod, samt från närliggande landsbygdskolonier och ungdjur. Istället för att leta efter enstaka mikrober använde de ”meta-omik” metoder — de läste allt DNA i proverna — för att samtidigt kartlägga tre saker: tarmmikrobiomet (alla närvarande bakterier), ”resistomet” (antibiotikaresistensgener) och ”virulomet” (gener som kan göra bakterier mer benägna att orsaka sjukdom). De analyserade också fladdermössens diet med hjälp av insekt-DNA och mätte flera tiotals antibiotikarester i avföringen.

Vad som lever i en fladdermus tarm

Teamet fann att tarmarna hos dessa stadslivande fladdermöss är fyllda med mångfaldiga bakterier och många resistens‑ och virulensgener, på nivåer som liknar de i förorenade miljöer som avloppsvatten eller djurgödsel. De flesta tarmbakterierna tillhörde ett fåtal stora grupper, där släkten som Clostridium, Klebsiella, Enterobacter, Lactococcus och Escherichia var särskilt vanliga. Resistensgener sträckte sig över ett brett spektrum läkemedelsklasser, inklusive multiresistens och kinolonresistens, medan virulensgener kopplades till egenskaper som vidhäftning till värdvävnad, förmåga att röra sig genom kroppen och att undkomma immunförsvaret. När forskarna undersökte var dessa gener sitter i bakteriegenomen fann de dock att de flesta fanns på kromosomer eller icke-mobila plasmider och sällan var kopplade till mobila genetiska element, vilket tyder på att deras förmåga att hoppa mellan bakterier är begränsad.

Stadsliv, plats och tid formar den dolda genpoolen

Studien jämförde sedan fladdermöss från två landsbygdslokaler med de från staden. Geografin visade sig vara viktig: de tre lokalerna skiljde sig markant vad gäller bakteriesamhällen liksom mönstren för resistens- och virulensgener. En landsbygdslokal visade faktiskt den rikaste samlingen av sådana gener, vilket antyder att lokal förorening eller jordbrukspraktiker där kan vara mer intensiva än i den närliggande staden. Under fortplantningssäsongen — från sen graviditet till avvänjning — förändrades också tarmens mikrobiella samhälle. Både resistens- och virulensgener ökade generellt över tiden i takt med förändringar i nyckelbakteriegrupper, särskilt Clostridium. Statistiska analyser indikerade att dessa mönster inte var slumpmässiga, utan drevs av konsekventa miljömässiga påfrestningar snarare än av tillfällig omfördelning.

Kost och antibiotika som tysta drivkrafter

Eftersom dessa fladdermöss är glupska insektsätare undersökte forskarna hur föda och läkemedelsrester korsar tarmens genpool. DNA-barcoding visade att fladdermössen konsumerade insekter från minst 16 ordningar, dominerade av flugor och fjärilar. Kosten blev mer varierad från graviditet till amning, sannolikt på grund av högre energibehov och säsongsvariation i insektstillgång. Kemiska analyser visade att avföringen innehöll flera klasser av antibiotika, särskilt sulfonamider, kinoloner och makrolider, med högre nivåer hos stadslivande fladdermöss än i de flesta landsbygdsprover. Kostsammansättningen matchade starkt antibiotikaprofilen, vilket tyder på att det fladdermössen äter exponerar dem för läkemedelsrester. I sin tur korrelerade specifika antibiotika med förekomst och abundans av motsvarande resistensgener — till exempel steg aminoglykosidkoncentrationer i takt med aminoglykosidresistensgener — vilket tyder på att kostburen antibiotikaexponering selekterar för resistenta bakterier i tarmen.

Vad som verkar spela mindre roll

Forskarna undersökte också om individuella egenskaper hos fladdermössen — som kön, ålder, kroppsstorlek eller reproduktiv status — påverkade tarmmikrobiomet eller dess innehåll av resistens- och virulensgener. I deras material gjorde dessa värdeegenskaper liten skillnad. Ungdjur, precis avvanda och som börjat söka föda själva, bar redan resistens- och virulensgenprofiler liknande vuxna. Författarna föreslår att delade viloplatser, omfattande nattliga rörelser och gemensam exponering för samma insektspredatorer och miljöföroreningar sannolikt överskuggar subtila skillnader mellan individer.

Vad detta betyder för människor och ekosystem

För en lekmannaläsare är huvudbudskapet att stadslivande fladdermöss inte bara är insektskontrollanter: deras tarmar speglar de kemiska och mikrobiella påfrestningar i de miljöer de använder. Kost och livsmiljö, mer än fladdermössens egen biologi, avgör vilka mikrober och vilka resistens- eller virulensgener som frodas inuti dem. Även om generna de bär uppvisar begränsad kapacitet att hoppa mellan bakterier, lyfter fynden fram fladdermöss som indikatorer på antibiotika- och föroreningsläckage från gårdar, städer och vattendrag in i vilda djur. Att övervaka dessa djur hjälper oss att förstå hur vår användning av antibiotika och andra kemikalier får ringar på vattnet i urbana ekosystem — och kan i förlängningen påverka människors hälsa.

Citering: Huang, L., Pu, YT., Zhao, YH. et al. Diet and environmental factors jointly drive the gut microbiome, resistome, and virulome of urban bats. npj Biofilms Microbiomes 12, 61 (2026). https://doi.org/10.1038/s41522-026-00930-y

Nyckelord: stadens fladdermöss, tarmmikrobiom, antibiotikaresistensgener, miljöförorening, viltvård one health