Обнаружение и генотипирование орального ВПЧ с помощью секвенирования следующего поколения в когорте здоровых палестинцев: пилотное исследование

Почему микроорганизмы во рту имеют значение

Большинство людей слышали о вирусе папилломы человека (ВПЧ) в связи с риском рака шейки матки, но гораздо меньше знают, что ВПЧ также может инфицировать рот и горло и способствовать развитию некоторых раков головы и шеи. В этом исследовании, проведённом в Палестине, подробно изучали ВПЧ, обитающий в ротовой полости здоровых взрослых. Используя современные методы чтения ДНК, исследователи хотели выяснить, какие типы ВПЧ присутствуют, как часто они встречаются и может ли высокотехнологичный подход надёжно работать в местных клиниках, где в настоящее время отсутствуют программы вакцинации или скрининга на ВПЧ.

В поисках скрытого вируса

ВПЧ — очень распространённое семейство вирусов, насчитывающее более 200 известных типов. Некоторые типы в основном вызывают безвредные бородавки, тогда как другие считаются «высокого риска», поскольку со временем они могут способствовать развитию рака шейки матки, ануса или полости рта и горла. Оральные инфекции ВПЧ часто протекают бессимптомно и могут тихо сохраняться годами, особенно у курильщиков или людей с ослабленным иммунитетом. В Европе и Северной Америке примерно у 5–7% здоровых людей обнаруживают ВПЧ в ротовой полости, но данных из Палестины почти нет. Без этой базовой информации органам здравоохранения трудно планировать кампании по вакцинации, разрабатывать программы скрининга или даже оценивать серьёзность местной проблемы с ВПЧ.

Забор мазков с щеки, а не анализ крови

Чтобы начать заполнять этот пробел, команда привлекла 75 взрослых, посещавших стоматологические клиники в центральной части Западного берега, в городах Рамалла и Вифлеем. Всем участникам был более 18 лет, и они сообщали об отсутствии серьёзных заболеваний или истории рака. Стоматологи аккуратно проводили стерильными тампонами по внутренней стороне щёк, языку и дну ротовой полости, чтобы собрать клетки. Каждый участник также заполнил короткую анонимную анкету о возрасте, поле, курении и базовых сведениях о ВПЧ и статусе вакцинации. Исследование сознательно было небольшим и спланировано как «пилотное» — его главная цель состояла в проверке, может ли сложный лабораторный метод надёжно обнаруживать и идентифицировать ВПЧ в оральных образцах этой популяции, а не в получении окончательной национальной статистики.

Превращение клеток щеки в генетические подсказки

В лаборатории исследователи извлекли ДНК из тампонов и использовали двухэтапный процесс амплификации, известный как вложенная ПЦР, для фокусировки на определённом участке генетического материала вируса, называемом геном L1. Этот участок действует как отпечаток, позволяющий отличить один тип ВПЧ от другого. Затем они подготовили амплифицированную ДНК для секвенирования следующего поколения (NGS) — высокопроизводительной технологии, которая параллельно читает миллионы коротких фрагментов ДНК. С помощью общедоступного программного обеспечения команда очистила сырые данные, выделила чтения, совпадавшие с их целью по ВПЧ, и сравнила эти последовательности с международными базами данных, чтобы точно определить, какие типы ВПЧ присутствуют. Чтобы снизить вероятность ложноположительных срабатываний от крошечных фрагментов посторонней ДНК, они считали образец действительно положительным только если в нём находилось по крайней мере 100 почти идентичных считываний последовательности для данного типа ВПЧ.

Что они обнаружили в здоровых ртах

Из 75 протестированных у 5 были явные свидетельства оральной инфекции ВПЧ, что соответствует показателю 6,7% — примерно так же, как в сообщениях из США и Ирана. Были идентифицированы три различных типа ВПЧ: HPV‑18 у двух человек, HPV‑31 у двух человек и HPV‑38 у одного человека. Примечательно, что HPV‑16 — тип, наиболее тесно связанный с раком головы и шеи в мире — не был обнаружен ни в одном образце. Найденные типы включают два хорошо известных штамма высокого риска (HPV‑18 и HPV‑31) и один менее знакомый тип, HPV‑38, который связывают с некоторыми кожными и оральными поражениями. С помощью инструментов генетического сравнения палестинские вирусные последовательности тесно кластеризовались с референсными штаммами из других стран, что подтвердило корректность типирования. Поскольку положительных случаев было всего пять, исследование не позволило надёжно связать инфекцию ВПЧ с возрастом, полом, курением или другими факторами образа жизни, и большинство инфицированных участников никогда прежде не слышали о ВПЧ.

Ранние сигналы и их значение

Это небольшое исследование не может точно сказать, насколько распространён оральный ВПЧ по всей Палестине, но оно показывает, что типы ВПЧ высокого риска присутствуют в ротовой полости в целом здоровых взрослых и что современное секвенирование ДНК успешно применимо к местным образцам. Появление HPV‑38, который не покрывается существующими вакцинами, и отсутствие HPV‑16 в этой небольшой выборке указывают на то, что состав типов ВПЧ в ротовой полости может отличаться от того, что наблюдается в шейке матки или в других странах. Для широкой публики главный вывод таков: ВПЧ — это не только проблема шейки матки; он может тихо инфицировать и рот, и современные инструменты теперь позволяют отслеживать такие инфекции более точно. Более крупные национальные исследования могли бы опираться на эту пилотную работу при формулировании вакцинационных политик, повышении общественной осведомлённости и, в конечном счёте, в профилактике будущих раков головы и шеи, связанных с ВПЧ.

Цитирование: Safi, B., Khalid, M. & Nasereddin, A. Oral HPV detection and genotyping by next-generation sequencing in a healthy Palestinian cohort: pilot study. Sci Rep 16, 7282 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-37318-z

Ключевые слова: оральный ВПЧ, рак головы и шеи, Палестина, генотипирование ВПЧ, секвенирование следующего поколения