Wykrywanie i typowanie HPV w jamie ustnej metodą sekwencjonowania następnej generacji w zdrowej kohorcie palestyńskiej: badanie pilotażowe

Dlaczego drobnoustroje w twoich ustach mają znaczenie

Większość osób słyszała o brodawczaku ludzkim (HPV) ze względu na jego związek z rakiem szyjki macicy, ale znacznie mniej ludzi wie, że HPV może też zakażać jamę ustną i gardło oraz przyczyniać się do niektórych nowotworów głowy i szyi. W tym badaniu przeprowadzonym w Palestynie dokładnie przeanalizowano występowanie HPV w jamie ustnej zdrowych dorosłych. Wykorzystując nowoczesne technologie odczytu DNA, badacze chcieli ustalić, jakie typy HPV występują, jak często się pojawiają oraz czy zaawansowane podejście można wiarygodnie stosować w lokalnych klinikach, które obecnie nie mają programów szczepień ani przesiewowych dotyczących HPV.

Poszukiwanie ukrytego wirusa

HPV to bardzo powszechna rodzina wirusów, obejmująca ponad 200 znanych typów. Niektóre typy wywołują głównie nieszkodliwe brodawki, podczas gdy inne uznaje się za „wysokiego ryzyka”, ponieważ z czasem mogą przyczyniać się do powstawania raka szyjki macicy, odbytu czy jamy ustnej i gardła. Zakażenia jamy ustnej HPV często nie dają objawów i mogą cicho utrzymywać się przez lata, szczególnie u osób palących lub z osłabionym układem odpornościowym. W Europie i Ameryce Północnej około 5–7% zdrowych osób nosi HPV w jamie ustnej, jednak niemal nie ma danych z Palestyny. Bez takich podstawowych informacji trudno służbom zdrowia planować programy szczepień, projektować badania przesiewowe czy ocenić, jak poważny jest lokalny problem związany z HPV.

Pobieranie wymazów z policzka, nie badania krwi

Aby częściowo wypełnić tę lukę, zespół zrekrutował 75 dorosłych odwiedzających gabinety stomatologiczne w centralnej części Zachodniego Brzegu, w miastach Ramallah i Betlejem. Wszyscy mieli ponad 18 lat i deklarowali brak poważnych chorób oraz historii nowotworów. Dentyści delikatnie przesuwali sterylne wymazy po wewnętrznych stronach policzków, języku i dnie jamy ustnej, aby pobrać komórki. Każdy uczestnik wypełnił też krótki anonimowy kwestionariusz dotyczący wieku, płci, palenia oraz podstawowej wiedzy o HPV i statusu szczepień. Badanie miało charakter celowy i było zaprojektowane jako „pilotażowe” — jego głównym celem było przetestowanie, czy zaawansowana metoda laboratoryjna może wiarygodnie wykrywać i identyfikować HPV w próbkach oralnych z tej populacji, a nie dostarczenie ostatecznych statystyk krajowych.

Przekształcanie komórek policzka w genetyczne wskazówki

W laboratorium badacze wyekstrahowali DNA z wymazów i zastosowali dwuetapowy proces amplifikacji, zwany zagnieżdżonym PCR, aby skupić się na określonym fragmencie materiału genetycznego wirusa — genie L1. Ten region działa jak odcisk palca rozróżniający poszczególne typy HPV. Następnie przygotowali powielone DNA do sekwencjonowania następnej generacji (NGS), technologii wysokoprzepustowej czytającej miliony krótkich fragmentów DNA równolegle. Korzystając z dostępnego bezpłatnie oprogramowania online, zespół oczyścił surowe dane, wyodrębnił odczyty pasujące do ich celów HPV i porównał te sekwencje z międzynarodowymi bazami, aby dokładnie określić, jakie typy HPV występowały. Aby zmniejszyć ryzyko fałszywych alarmów wynikających z drobnych zanieczyszczeń DNA, próbkę uznano za naprawdę dodatnią tylko wtedy, gdy zawierała co najmniej 100 niemal identycznych odczytów sekwencji dla danego typu HPV.

Co znaleziono w zdrowych ustach

Spośród 75 przebadanych osób u 5 wykryto wyraźne dowody zakażenia HPV w jamie ustnej, co odpowiada częstości 6,7% — podobnej do doniesień ze Stanów Zjednoczonych i Iranu. Zidentyfikowano trzy różne typy HPV: HPV‑18 u dwóch osób, HPV‑31 u dwóch osób oraz HPV‑38 u jednej osoby. Uderzające jest to, że HPV‑16 — typ najsilniej związany z nowotworami głowy i szyi na świecie — nie został wykryty w żadnej próbce. Znalezione typy obejmują dwa dobrze znane szczepy wysokiego ryzyka (HPV‑18 i HPV‑31) oraz jeden mniej znany typ, HPV‑38, powiązany z niektórymi zmianami skórnymi i oralnymi. Przy użyciu narzędzi do porównywania genetycznego sekwencje wirusów z Palestyny grupowały się blisko szczepów referencyjnych z innych krajów, co potwierdzało poprawność typowania. Ponieważ tylko pięć osób było dodatnich, badanie nie mogło wiarygodnie powiązać zakażenia HPV z wiekiem, płcią, paleniem czy innymi czynnikami stylu życia, a większość zakażonych uczestników nigdy wcześniej nie słyszała o HPV.

Wstępne sygnały i ich znaczenie

To niewielkie badanie nie pozwala dokładnie określić, jak powszechny jest HPV w jamie ustnej w całej Palestynie, ale pokazuje, że typy wysokiego ryzyka HPV występują w jamach ustnych pozornie zdrowych dorosłych i że zaawansowane sekwencjonowanie DNA można skutecznie zastosować do lokalnych próbek. Pojawienie się HPV‑38, który nie jest objęty obecnymi szczepionkami, oraz brak HPV‑16 w tej niewielkiej grupie sugerują, że skład typów HPV w jamie ustnej może różnić się od obserwowanego w szyjce macicy lub w innych krajach. Dla czytelników niebędących specjalistami główne przesłanie jest takie, że HPV to nie tylko problem szyjki macicy: może cicho zakażać także jamę ustną, a nowoczesne narzędzia umożliwiają teraz dokładniejsze śledzenie tych zakażeń. Większe, ogólnokrajowe badania mogłyby rozwinąć tę pilotażową pracę, aby wspierać politykę szczepień, zwiększać świadomość społeczną i ostatecznie pomagać w zapobieganiu przyszłym nowotworom głowy i szyi związanym z HPV.

Cytowanie: Safi, B., Khalid, M. & Nasereddin, A. Oral HPV detection and genotyping by next-generation sequencing in a healthy Palestinian cohort: pilot study. Sci Rep 16, 7282 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-37318-z

Słowa kluczowe: HPV w jamie ustnej, nowotwory głowy i szyi, Palestyna, typowanie HPV, sekwencjonowanie następnej generacji