ミャンマーの小型哺乳類からの温城（Wencheng）ネズミコロナウイルスとカルディオウイルスの検出

人の健康にとって小さな動物が重要である理由

私たちの多くは、都市や農地、あるいは住まいを共有するネズミやハツカネズミ、トガリネズミのことをめったに意識しません。しかし、これらの小型哺乳類は、人に跳び移ることのあるウイルスを静かに宿していることがあります。COVID-19パンデミックはそのことを世界に思い出させました。本研究は、生物多様性に恵まれる一方で疾病監視が限られるミャンマーで、身近な小型哺乳類にどのようなウイルスが循環しているかを調べ、目の前にひそむ注目すべき二つのウイルスを明らかにします。

人と動物が接する場所で野生動物を観察する

研究者たちは2017年から2018年にかけて、ミャンマーのヤンゴン地域とカイン州のいくつかの現地で作業しました。これらの地点は、保護地域に近い村や洞窟サイトなど、人、家畜、野生動物が頻繁に交わる場所として選ばれました。フィールドチームは人道的に野外のネズミ、ハツカネズミ、トガリネズミを捕獲し、種を同定し、直腸スワブを採取したのち動物を放獣しました。目的は単純かつ野心的でした：人と動物の境界で生活するこれら小型哺乳類に存在する全RNAウイルスのスペクトルを偏りなく把握することです。

見えないものを見るための遺伝学的手法

研究チームは一度に一つのウイルスを検査する代わりに、メタゲノム次世代シーケンシングという強力な手法を用いました。これは各サンプルから何百万もの遺伝情報断片を読み取る方法です。これらの断片を大規模な公的データベースと照合することで、既知のウイルスや未知に近い近縁ウイルスを検出できます。高度な計算解析により部分ゲノムが組み立てられ、検出されたウイルスが進化の「家系図」上のどこに位置するかを示すことで、ミャンマーでの発見が他地域で報告されたウイルスとどう関連するかを明らかにしました。

トガリネズミのコロナウイルスはより広い分布を示す

ハロウガ国立公園で採取された一頭の東南アジア産トガリネズミ（Crocidura fuliginosa）から、研究チームは温城（Wencheng）トガリネズミウイルスに近縁のコロナウイルスを見つけました。このウイルスは中国の家トガリネズミで最初に発見されたもので、ミャンマーおよび本種での報告は今回が初めてです。ウイルス全ゲノムの一部しか回収できませんでしたが、いくつかの重要遺伝子を含み、既知の温城トガリネズミウイルス配列と約90パーセントの類似性を示しました。系統樹上では、ミャンマーのウイルスは同じ亜群内で独立した長い枝に位置しており、局所的に独自の系統が存在することと、この地域のトガリネズミウイルスが従来認識されていたより多様であることを示唆しています。

中国由来の近縁種と結びつくネズミのウイルス

同じ公園のドブネズミ（Rattus norvegicus）から、研究者たちはカルディオウイルスの部分ゲノムを同定しました。カルディオウイルスは齧歯類を感染させ、場合によっては人にも感染することがあるウイルス群です。このウイルスはHlawga-18と名付けられ、これまでに中国で野生のネズミから見つかっている齧歯類カルディオウイルスに最も近く、高いが完全には一致しない遺伝的類似性を共有していました。系統樹に配置すると、Hlawga-18はこれら中国株と密接にクラスターを形成し、人に感染することが知られるサフォールドウイルス（Saffold virus）群の近くに位置しました。本研究だけではこのネズミのウイルスが人に感染するか否かは判断できませんが、人由来のウイルスと近縁であることは、より注意深く監視すべき候補であることを示しています。

これらの発見が人と自然にもたらす意味

一般読者にとっての主要なメッセージは、土地利用の変化、農業、都市化がミャンマーの野生動物群集を再形成し、小型哺乳類が優勢になる方向に働くと、さまざまなウイルスを運ぶ動物が増える可能性があるということです。トガリネズミのコロナウイルスとネズミのカルディオウイルスが、人々が暮らし働く場所で既に循環していることを示した本研究は、継続的で先手を打つ監視の重要性を強調します。どのウイルスが存在し、既知の人獣共通病原体とどのような関係があり、どこで見つかるかを理解することは、アウトブレイクが起きてから対応するのではなく、将来の飛び移りリスクを予測するうえで公衆衛生当局の助けになります。

引用: Paoli, J.E., Aung, O., Lilak, A.A. et al. Detection of Wencheng shrew virus and cardiovirus from small mammals in Myanmar. Sci Rep 16, 8885 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-38406-w

キーワード: 人獣共通感染症ウイルス, 小型哺乳類, ミャンマー, ウイルス監視, 齧歯類とトガリネズミ