Clear Sky Science · he

אינטגרציה פונקציונלית של גנומריקה של רשתות גנים הקשורות לגליקוליזה חושפת סמנים פרוגנוסטיים ויסות של המיקרו‑סביבה החיסונית בסרטן השד

· חזרה לאינדקס

מדוע גידולים ש"שורפים" סוכר חשובים עבור המטופלות

תאי סרטן השד לעתים קרובות מתמיינים לשימוש בסוכר בצורה בלתי שגרתית, גם כאשר החמצן בשפע. שינוי זה בשימוש באנרגיה, המכונה גליקוליזה, עושה יותר מאשר להזין את צמיחת הגידול – הוא יכול לעצב את תאי המערכת החיסונית שסביב הסרטן ולהשפיע על ההסתגלות וההישרדות של המטופלות. מחקר זה משלב מאגרי נתונים גנטיים נרחבים, מדידות ברמת תא יחיד ודגמי מחשב כדי להראות כיצד גידולים רעבים לסוכר בשד קשורים לנוף חיסוני מובחן, להבדלים בהישרדות המטופלות ולאפשרויות תרופתיות חדשות.

Figure 1
Figure 1.

מבט פנימי על הגידולים דרך עדשות נתונים רבות

החוקרים החלו באיסוף סוגי נתונים שונים מאלפי נשים עם סרטן השד. הם השתמשו בפרופילים של גידולים צוברים מקונסורציונים גדולים (TCGA ו‑METABRIC), בריצוף RNA בתא יחיד מדגימות מטופלות וברשומות גנטיות שמקשרות וריאנטים בדנ״א לשינויים בפעילות גנים. ממקורות אלה הרכיבו רשימה של למעלה מארבעה אלפים גנים המעורבים בגליקוליזה, ולאחר מכן צמצמו אותה לכמה מאות שהתבטאו באופן חריג בגידולים והיו קשורים חזק לביולוגיית סרטן השד. בעזרת למידת מכונה בנו ציון גליקוליזה של 16 גנים שניתן לחשב לכל גידול.

בקבוצות סיכון המחולקות לפי שימוש הגידול בסוכר

כאשר המטופלות חולקו לקבוצות בעלות ציון גבוה ונמוך, הופיעו הבדלים ברורים בתוצאות. גידולים עם ציון גליקוליזה גבוה נטו לשאת מוטציות רבות יותר, להפגין סימנים לחלוקה תפקודית מהירה של תאים, ולהיות מקושרים להישרדות כוללת גרועה יותר. דפוס זה היה בולט במיוחד בסוגים הרגישים להורמונים (Luminal A ו‑B) ובסרטן השד הטריפל‑נегטיבי, שבהם ציונים גבוהים סומנו עם זמני הישרדות קצרי משמעות. על ידי שילוב ציון הגליקוליזה עם מידע קליני בסיסי כגון גיל ובステייג', הצוות יצר נומוגרמה קריאה שקלתה והעריכה את סיכויי ההישרדות לשנה, שלוש שנים וחמש שנים בדיוק רב יותר מאשר מדדים מסורתיים בלבד.

שכונות חיסוניות שנוצרות על ידי מטבוליזם הגידול

המחקר בדק כיצד החתימה המטבולית הזו מתקשרת ל"שכונה" החיסונית סביב הגידולים. באמצעות אלגוריתמים שמעריכים אילו תאי חיסון קיימים במדגמי צבר, נמצא כי בגידולים בעלי ציון גבוה יש שפע של מקרופאגים בסוג M2 ותאים אחרים הקשורים לדיכוי ודלקת כרונית, בעוד שכמות תאי CD8 הרוצחים ותאי דנטריטיים מציגי‑אנטיגן הייתה נמוכה יותר. בניגוד לכך, גידולים בעלי ציון נמוך נטו לשכון בסביבה חיסונית יותר "חמה", עם תאי T קטלניים פעילים יותר ותאי B מועילים. ריצוף בתא יחיד אישר שבתוך רקמת הגידול, תאי חיסון מסוימים — בייחוד תאים מיאלואידים ותאי T — הציגו פעילות גליקוליטית גבוהה יותר, מה שמרמז שמצב המטבוליזם של הגידול והתנהגות תאי החיסון קשורים זה בזה באופן הדוק.

Figure 2
Figure 2.

אותות בין‑תאיים וגנים מפתח שמגנים או מסכנים

בהעמקה נוספת, הצוות מיפה איך סוגי תאים שונים מתקשרים זה עם זה באמצעות מולקולות איתות. תאים מיאלואידיים עם גליקוליזה גבוהה הסתמכו במידה רבה על מסלולים כגון MHC‑II, MIF ו‑SPP1 לתקשורת, בעוד שתאי T נטו למסלולים של MHC‑I, CCL ו‑CXCL. תבניות אלה נבדלו בין מצבי גליקוליזה גבוהים ונמוכים ובין תתי‑סוגי סרטן השד, דבר שמרמז מדוע חלק מהגידולים עמידים יותר למתקפה חיסונית. כדי לבחון סיבתיות, החוקרים השתמשו בגישה גנטית הנקראת רנדומיזציה מנדלית. הם מצאו שפעילות גנטית גבוהה יותר מונעת‑גנטית של שני גנים, NT5E ו‑NRG1, הייתה משויכת לסיכון קל נמוך יותר לסרטן השד, בעוד שפעילות גבוהה של S100B נקשרה לסיכון מוגבר. ניסויים מעבדתיים אימתו כי גנים אלה משנים בבורות תאי סרטן השד, ומחקר דוקינג ממוחשב הצביע על כך שתרופות קיימות כגון trametinib ו‑AZD8055 עשויות להיקשר בעוצמה לחלבונים הקשורים לרשת הגליקוליטית הזאת.

מה משמעות הדבר לטיפול בעתיד

בסיכום, המחקר מצייר תמונה שבה גידולים שתלויים במידה רבה ב"שריפת" סוכר לא רק גדלים מהר יותר אלא גם בונים סביבה חיסונית עוינת יותר שמגנה עליהם מפני תקיפה. על ידי לכידת התנהגות זו בציון של 16 גנים, יתכן שביתר קליני המטפלים יוכלו בעתיד למיין טוב יותר מטופלות לקבוצות סיכון ולהתאים בחירות טיפוליות. זיהוי גנים ספציפיים המגנים או מסכנים, לצד מועמדי תרופות שממוקדות במסלולים אלה, פותח דרכים עתידיות לשילוב טיפולים הפוגעים במטבוליזם יחד עם אימונותרפיה. אם יאומתו בניסויים קליניים, מפת דרכים זו של מטבוליזם‑חיסון עשויה לסייע להמיר יותר גידולים סרטן השד מ"קרים" חיסונית ל"חמים", ובכך לשפר תוצאות עבור נשים ברחבי העולם.

ציטוט: Niu, Y., Jiang, Y., Wang, Z. et al. Functional genomics integration of glycolysis-related gene networks reveals prognostic biomarkers and immune microenvironment regulation in breast cancer. Sci Rep 16, 9583 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-025-29391-7

מילות מפתח: סרטן השד, מטבוליזם של הגידול, גני גליקוליזה, מיקרו‑סביבה חיסונית, אונקולוגיה מדויקת