Contrôle durable de Phytophthora capsici chez le poivron par utilisation encapsulée de Limosilactobacillus fermentum et réduction des doses fongicides

Germes amicaux qui aident les poivrons à lutter contre les maladies

Le poivron est un aliment de base dans les cuisines du monde entier, mais un organisme ressemblant à un mildiou et aimant l’eau, Phytophthora capsici, peut anéantir des parcelles entières en faisant pourrir racines et tiges et en laissant les agriculteurs sans récolte. Cette étude explore un allié inattendu contre cette maladie : une bactérie bénéfique que l’on trouve habituellement dans le yaourt. En conditionnant ces « bons germes » dans de minuscules billes protectrices et en les associant à des quantités réduites de fongicide chimique, les chercheurs montrent qu’il est possible de protéger les plants de poivron tout en diminuant l’usage de pesticides.

Une menace cachée dans le sol

Phytophthora capsici vit dans les sols humides et attaque de nombreux légumes, notamment les poivrons. Une fois qu’il infecte une plante, il peut provoquer la pourriture des racines, des lésions sombres à la base de la tige, le flétrissement et souvent la mort de la plante. Les producteurs ont longtemps compté sur les fongicides chimiques pour contenir ce pathogène, mais un usage intensif peut polluer l’environnement et favoriser l’émergence de souches résistantes. L’équipe à l’origine de cette étude a cherché une méthode plus propre et plus durable pour protéger les poivrons en recourant au biocontrôle : utiliser un organisme vivant pour contenir un autre.

Transformer un microbe du yaourt en garde du corps des plantes

Les chercheurs ont commencé par collecter des échantillons de yaourt traditionnel et isoler des dizaines de souches de bactéries lactiques, le même grand groupe qui fermente le lait et d’autres aliments. Ils ont testé chaque souche contre le pathogène qui tue les poivrons en laboratoire. Une souche remarquable, nommée GS‑15 et identifiée comme Limosilactobacillus fermentum, a réduit la croissance du pathogène d’environ moitié lorsqu’elles ont été cultivées ensemble sur la même boîte. Même les gaz libérés par GS‑15 ralentissaient le pathogène, ce qui suggère que ce microbe produit un cocktail de substances défensives naturelles. Lorsque l’équipe a ajouté de l’acide lactique pur — le composé acide que ces bactéries libèrent souvent — le pathogène a été de plus en plus affecté à mesure que la concentration d’acide augmentait, montrant que cette molécule simple est un élément clé de l’effet protecteur.

Protéger les protecteurs avec de petites billes

Il y avait un obstacle : le fongicide standard pour poivron, Previcur Energy, éliminait facilement les bactéries bénéfiques, rendant difficile la combinaison des deux outils. Pour résoudre ce problème, les scientifiques ont piégé GS‑15 à l’intérieur de petites billes d’alginate, un gel doux dérivé d’algues déjà utilisé dans l’alimentation et les produits médicaux. À l’intérieur de ces billes, les bactéries survivaient même exposées à des niveaux élevés de fongicide. L’encapsulation n’a pas seulement servi de bouclier : elle a en fait amélioré leur efficacité. Dans des tests en laboratoire, GS‑15 protégé par les billes a bloqué environ trois cinquièmes de la croissance du pathogène, surpassant nettement la forme non protégée. Cela suggère que les billes permettent à davantage de bactéries de rester vivantes et actives à proximité du pathogène.

Essais en serre : des plantes plus saines avec moins d’aide chimique

Puis l’équipe est passée à des expérimentations en serre avec trois variétés commerciales de poivron. Lorsque les plantes ont été exposées uniquement au pathogène, elles sont devenues rabougries, avec des racines et des tiges sombres et pourries et des taux élevés de maladie. Le traitement avec le fongicide à pleine dose a amélioré la survie mais a aussi légèrement réduit la croissance par rapport aux plantes saines non inoculées. En revanche, l’ajout des bactéries GS‑15 une semaine avant l’infection a fortement réduit le niveau de maladie et aidé les racines et les parties aériennes à rester plus proches de la taille normale. Les résultats les plus probants ont été obtenus lorsque les chercheurs ont utilisé GS‑15 encapsulé dans l’alginate, seul ou associé à seulement la moitié de la dose habituelle de fongicide. Dans toutes les variétés de poivron, cette combinaison a fait chuter l’incidence de la maladie à environ un plant sur dix ou moins ; dans de nombreux cas, la maladie a été totalement empêchée et la biomasse des plantes est revenue proche des niveaux sains.

Ce que cela pourrait signifier pour les agriculteurs et l’alimentation

Ce travail montre qu’une bactérie probiotique connue pour soutenir la santé humaine peut aussi servir de puissant garde du corps pour les cultures. En emprisonnant Limosilactobacillus fermentum GS‑15 dans des billes d’alginate et en l’associant à des quantités réduites de fongicide, les chercheurs ont obtenu un meilleur contrôle d’une maladie dévastatrice du poivron que les produits chimiques à pleine dose seuls. Pour les non‑spécialistes, la conclusion est simple : de minuscules microbes amicaux présents dans des aliments courants pourraient aider les agriculteurs à cultiver des poivrons de façon plus durable, en utilisant moins de pesticides synthétiques tout en maintenant des rendements élevés. Avec des essais supplémentaires en plein champ et le développement de méthodes de production à grande échelle, ces traitements à base de microbes pourraient devenir un outil plus écologique pour protéger de nombreuses cultures contre les maladies du sol.

Citation: Abdollahi, M., Rahaiee, S., Nami, Y. et al. Sustainable control of Phytophthora capsici in bell pepper using encapsulated Limosilactobacillus fermentum and reduced fungicide doses. Sci Rep 16, 9262 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-39603-3

Mots-clés: biocontrôle, maladie du poivron, bactéries lactiques, agriculture durable, probiotiques pour plantes