Première détection de Diplodia bulgarica, un nouveau pathogène responsable du chancre noir des pommiers en Pologne

Une menace silencieuse pour le fruit préféré de la Pologne

La pomme est un aliment de base sur les tables polonaises et une exportation importante : tout ce qui tue les pommiers peut rapidement affecter les exploitations agricoles, les marchés et les budgets des ménages. Cette étude rapporte la première apparition en Pologne d’un champignon destructeur, Diplodia bulgarica, responsable d’une maladie connue sous le nom de chancre noir. En retraçant la manière dont cet envahisseur microscopique endommage l’écorce et le bois et en identifiant précisément l’organisme en cause, les chercheurs mettent en garde les producteurs et les jardiniers contre une menace émergente que les pesticides actuels ne contrôlent pas.

Des blessures étranges dans un verger historique

À l’été 2024, des scientifiques examinant un jardin historique à Nieborów, dans le centre de la Pologne, ont constaté des changements préoccupants sur des pommiers âgés de 24 et 60 ans. Branches et troncs présentaient des zones sombres et enfoncées, et l’écorce autour de ces zones se détachait facilement, révélant un bois brun foncé à presque noir. De nombreux arbres affectés avaient un feuillage plus pâle et des fruits plus petits que leurs voisins. Plus de 40 % des arbres de la parcelle d’un hectare présentaient ces signes, ce qui suggère qu’il ne s’agissait pas d’un phénomène rare mais d’une épidémie d’ampleur. Comme des symptômes similaires avaient récemment été attribués au champignon Diplodia bulgarica dans d’autres pays, l’équipe a cherché à déterminer si le même coupable avait atteint la Pologne.

À la recherche du coupable caché

Pour découvrir la cause, les chercheurs ont prélevé de petits morceaux de bois à la frontière entre tissu sain et tissu malade sur des branches endommagées. Après désinfection de surface de ces échantillons, ils ont placé de minuscules fragments sur des gels nutritifs et laissé croître les champignons éventuels. En moins d’une semaine, 15 cultures se sont développées et présentaient un aspect distinctif : centres foncés et bords cotonneux gris‑blanc. Lorsque le champignon a été encouragé à former des spores sur des milieux spéciaux, il a produit des structures noires, en forme de globe, et des spores ovales à paroi épaisse dont la taille et la couleur correspondaient aux descriptions de Diplodia bulgarica publiées antérieurement. Le même type de champignon a également été trouvé sur les arbres voisins de 60 ans, suggérant que les plantations plus anciennes peuvent servir de réservoir d’infection à long terme.

La preuve qu’il peut tuer de jeunes arbres

L’apparence seule ne suffit pas pour prouver la culpabilité, aussi l’équipe a‑t‑elle réalisé un test classique de causalité de la maladie. Ils ont cultivé le champignon suspect en laboratoire, pratiqué de petites entailles sur les tiges principales de jeunes pommiers en pot, et inséré de petits greffons du mycélium. En deux semaines, des lésions sombres sont apparues autour des blessures ; en trois semaines, ces zones nécrotiques s’étendaient jusqu’à 17 centimètres le long de la tige. Après six semaines, tous les arbres inoculés étaient morts. Lorsque les scientifiques ont réisolé des champignons à partir du bois mort, ils ont retrouvé le même organisme qu’ils avaient utilisé pour l’inoculation initiale, satisfaisant ainsi les postulats de Koch généralement employés pour démontrer qu’un microbe cause bien une maladie.

Lire le code‑barres génétique du champignon

Pour confirmer l’identité du pathogène sans équivoque, les chercheurs ont eu recours à l’analyse de l’ADN. Ils ont extrait le matériel génétique de sept cultures fongiques représentatives et amplifié deux régions marqueurs largement utilisées — l’une issue de l’ADN ribosomal et l’autre d’un gène appelé facteur d’élongation de la traduction 1‑alpha — qui agissent ensemble comme un code‑barres pour les espèces fongiques. La comparaison de ces séquences avec une base de données mondiale a montré des correspondances quasi parfaites avec des souches connues de Diplodia bulgarica : 100 % d’identité dans une région et 99,8 % dans l’autre. Cette concordance génétique serrée, associée à la forme des spores et aux symptômes observés, laisse peu de place à des explications alternatives.

Ce que cela signifie pour les producteurs et les jardiniers

Ce travail documente le premier cas confirmé de Diplodia bulgarica sur pommiers en Pologne, reliant fermement les symptômes du chancre noir à un champignon précis grâce à des observations de terrain, des tests d’infection et un « empreinte ADN ». Parce que la maladie peut tuer de jeunes arbres en quelques semaines et qu’il n’existe actuellement en Pologne aucun produit chimique approuvé ciblant directement ce type de pathogènes de l’écorce et du bois, les résultats délivrent un message clair : surveiller les vergers, éliminer rapidement le bois infecté et comprendre les modes de dispersion de ce champignon seront essentiels pour protéger tant les plantations historiques que la production commerciale de pommes.

Citation: Głos, H., Michalecka, M. First detection of Diplodia bulgarica, a new pathogen causing black canker of apple trees in Poland. Sci Rep 16, 7433 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-38714-1

Mots-clés: maladie du pommier, chancre noir, Diplodia bulgarica, pathologie verger, pathogène fongique des plantes