Abondance altérée chez les patients atteints de cancer de bactéries codant pour la diadénylate cyclase dans le microbiote intestinal

Pourquoi les bactéries de notre intestin comptent pour la prise en charge du cancer

Ces dernières années, les scientifiques ont découvert que les trillions de microbes vivant dans nos intestins peuvent influencer la façon dont notre système immunitaire repère et combat les tumeurs. Cette étude explore un signal chimique particulier produit par des bactéries intestinales, appelé c-di-AMP, et pose une question simple mais importante : les personnes atteintes de cancer ont-elles moins de bactéries produisant ce signal que les personnes en bonne santé — et cela pourrait-il affecter l’efficacité des traitements contre le cancer ?

Un petit signal au rôle majeur

Les bactéries utilisent le c-di-AMP comme système d’alarme interne pour gérer le stress, réparer les dommages et contrôler leur croissance. Mais cette molécule ne reste pas confinée à l’intérieur des microbes. Nos cellules immunitaires peuvent la détecter via une protéine appelée STING, qui active des défenses antivirales et antitumorales. Des travaux antérieurs chez l’animal suggéraient que le c-di-AMP bactérien peut renforcer les effets des traitements anticancéreux modernes, comme les inhibiteurs de points de contrôle immunitaire et la radiothérapie. Cela a fait naître l’hypothèse qu’un plus grand nombre de bactéries productrices de c-di-AMP dans l’intestin pourrait aider le système immunitaire à mieux contrôler le cancer.

Cartographier les bactéries intestinales utiles

Pour explorer cette idée, les chercheurs ont d’abord cherché à identifier quelles bactéries du microbiote humain peuvent produire du c-di-AMP. Ils ont analysé un gigantesque catalogue de protéines provenant de plus de 289 000 génomes microbiens intestinaux à la recherche des gènes codant l’enzyme diadénylate cyclase, qui synthétise le c-di-AMP. À partir de cela, ils ont établi une base de données de plus de quatre mille de ces enzymes réparties dans près de quatre mille espèces intestinales. Ces microbes capables de produire du c-di-AMP se sont révélés très fréquents dans des intestins sains et largement distribués à travers de nombreux groupes bactériens, en particulier ceux qui sont des résidents typiques d’un écosystème intestinal équilibré.

Comparer personnes saines et patients atteints de cancer

L’équipe a ensuite analysé l’ADN intestinal de 190 volontaires sains et de 569 patients atteints de mélanome avancé, de cancer du poumon ou du rein, tous sur le point de commencer une immunothérapie. Ils ont vérifié quelle proportion des bactéries présentes dans l’intestin de chaque personne appartenait à des espèces capables de fabriquer le c-di-AMP. Les individus en bonne santé présentaient des niveaux très élevés : en moyenne, environ 96 % de leurs bactéries intestinales pouvaient produire cette molécule. Chez les patients atteints de cancer, cependant, on observait une baisse notable, à environ 92 %, certains patients affichant des niveaux beaucoup plus bas. Parallèlement, les patients cancéreux avaient davantage de certains microbes, comme Escherichia coli et d’autres Proteobacteria, ainsi que de nombreuses Bifidobacteries — des groupes qui, en général, ne possèdent pas les gènes nécessaires à la synthèse du c-di-AMP.

Des liens avec la réponse au traitement — mais sans seuil net

Parce que des études antérieures laissaient présager que des niveaux plus élevés de c-di-AMP pourraient améliorer la réponse aux thérapies contre le cancer, les chercheurs ont aussi comparé les patients répondant à l’immunothérapie avec ceux qui n’y répondaient pas. Les patients répondeurs avaient tendance à présenter un peu plus d’espèces productrices de c-di-AMP et moins de variation entre individus, mais ces différences étaient trop faibles pour établir une preuve statistique claire. L’étude se basait sur la présence des bactéries, et non sur des mesures directes de c-di-AMP dans les selles ou le sang, et elle ne suivait pas précisément comment ni quand les bactéries libèrent cette molécule pour que le système immunitaire la détecte. Ces lacunes peuvent aider à expliquer pourquoi les résultats thérapeutiques ne s’alignaient pas de manière nette sur les profils bactériens.

Ce que cela pourrait signifier pour les traitements du cancer à venir

Globalement, les résultats suggèrent que les bactéries capables de produire du c-di-AMP constituent une composante clé d’une communauté intestinale saine et que les patients atteints de cancer montrent souvent un déplacement vers des microbes dépourvus de cette fonction. Pour le non-spécialiste, la conclusion est que certaines de nos bactéries intestinales quotidiennes peuvent discrètement soutenir les défenses anticancéreuses de l’organisme en envoyant des signaux moléculaires d’« aide » au système immunitaire. Si cette étude ne permet pas encore d’affirmer que rétablir ces bactéries améliorera l’efficacité de l’immunothérapie, elle ouvre des pistes prometteuses pour concevoir des probiotiques, des régimes ou des thérapies microbiennes visant à renforcer la signalisation du c-di-AMP et, un jour, potentiellement, à accroître l’efficacité des traitements contre le cancer.

Citation: Candeliere, F., Sola, L., Busi, E. et al. Altered abundance in cancer patients gut of diadenylate cyclase-encoding bacteria. Sci Rep 16, 6070 (2026). https://doi.org/10.1038/s41598-026-35425-5

Mots-clés: microbiote intestinal, immunothérapie du cancer, signalisation bactérienne, c-di-AMP, voie STING