Base de données synthétisée des observations d’abeilles sauvages et de syrphes en Europe

Pourquoi ces petits volants comptent pour nous tous

Partout en Europe, les abeilles sauvages et les syrphes maintiennent silencieusement nos exploitations, jardins et paysages naturels en vie en transportant le pollen de fleur en fleur. Pourtant, beaucoup de ces insectes disparaissent, et jusqu’à présent scientifiques et décideurs étaient confrontés à un problème simple mais majeur : il n’existait pas de carte unique et fiable montrant où ces espèces vivent réellement ni comment leurs répartitions évoluent. Cette étude rassemble des millions d’observations éparpillées dans des musées, des carnets, des bases de données nationales et des plateformes de science participative pour constituer deux bases de données européennes unifiées, vérifiées et accessibles au public pour les abeilles sauvages et les syrphes.

Rassembler des données dispersées sous un même toit

Pendant des décennies, l’information sur les pollinisateurs sauvages a été collectée par des taxonomistes, des experts nationaux, des organisations de protection de la nature et des amateurs passionnés. Mais ces données restaient cloisonnées : étiquettes sur des spécimens de musée, tableaux sur des ordinateurs personnels et portails en ligne qui ne communiquaient pas entre eux. Les auteurs de cette étude ont entrepris de reconstituer un panorama européen unique pour deux groupes clés de pollinisateurs : les abeilles sauvages et les syrphes. Ils ont contacté des spécialistes à travers l’Europe, tiré parti de projets européens antérieurs, exploité des dépôts publics et des portails en libre accès, et même numérisé des données enfermées dans des articles publiés et des collections historiques. Le résultat est un vaste ensemble brut de plus de cinq millions d’observations pouvant enfin être comparées et analysées ensemble.

Transformer des observations brutes en données fiables

Il ne suffisait pas d’empiler tous ces enregistrements dans un seul fichier : les sources utilisaient des formats, des noms et des précisions différents. L’équipe a d’abord convenu d’un modèle commun appelé « Pollinator Core », conçu pour être compatible avec les normes internationales existantes mais adapté aux pollinisateurs. Chaque enregistrement devait contenir au minimum le nom de l’espèce et le lieu où elle avait été trouvée. Les chercheurs ont ensuite standardisé les dates, converti une multitude de formats de coordonnées en valeurs modernes de latitude–longitude, traduit les informations de sexe et de comptage en un code commun, et ajouté des libellés cohérents de pays et de régions en s’appuyant sur des cartes numériques. Ils ont aussi quantifié l’incertitude de chaque localisation, afin que les utilisateurs puissent juger de la précision de chaque point sur le terrain.

Vérifier les noms, les lieux et les erreurs possibles

Les noms d’insectes changent au fil du temps à mesure que la connaissance scientifique s’affine, et les fautes de frappe sont fréquentes dans les grandes collections. Pour y remédier, les auteurs ont construit des « dictionnaires taxonomiques » détaillés pour les abeilles et les syrphes, en combinant les listes de référence européennes les plus récentes avec de longues listes d’erreurs d’orthographe connues et d’anciens noms. Des outils logiciels et des techniques de correspondance approximative ont aidé à détecter et corriger les erreurs probables, tandis que les enregistrements qui ne pouvaient pas être identifiés de manière fiable ont été supprimés. L’équipe a également vérifié que chaque point se trouvait à l’intérieur des limites géographiques convenues pour l’Europe et sur la terre plutôt qu’en mer. Pour les syrphes, ils ont pu supprimer en toute sécurité les doublons exacts ; pour les abeilles, la structure de certains jeux de données rendait cette opération trop risquée, si bien que la duplication potentielle est reconnue comme une limitation mineure plutôt qu’éliminée systématiquement.

Le regard d’experts sur des millions de points

Même après un nettoyage automatisé, les bases de données n’étaient pas considérées comme achevées tant que des experts humains ne s’étaient pas exprimés. Les enregistrements d’abeilles ont été répartis en groupes par famille ou tribu, et des spécialistes ont reçu des cartes et des tableaux à examiner. Ils ont signalé les points suspects, ajouté des observations oubliées lorsque la présence d’une espèce leur semblait évidente, et répété ce processus jusqu’à ce que les répartitions paraissent réalistes. Pour les syrphes, les spécialistes ont utilisé des logiciels de cartographie pour repérer les enregistrements aberrants et consulté des experts régionaux si nécessaire. Cette étape a supprimé des centaines de milliers d’enregistrements douteux d’abeilles et des dizaines d’enregistrements de syrphes, tout en ajoutant près de 900 000 observations d’abeilles jugées fiables. Des étiquettes spéciales ont aussi été ajoutées lorsque nécessaire, par exemple pour un ensemble d’enregistrements historiques d’abeilles décrivant des aires générales plutôt que des spécimens individuels.

Une nouvelle base pour protéger les pollinisateurs

Le produit final est constitué de deux bases d’occurrence harmonisées contenant environ 4,34 millions d’enregistrements d’abeilles et 1,04 million d’enregistrements de syrphes, couvrant 97 % des espèces connues de chaque groupe en Europe. Ces données sont accessibles librement via la plateforme Zenodo et seront maintenues comme ressources évolutives avec des mises à jour futures par de grands projets de l’UE. Pour le grand public, le message principal est simple : nous disposons désormais de la carte la plus complète et la mieux vérifiée de la répartition des abeilles sauvages et des syrphes en Europe. Cela aidera les scientifiques à mesurer les déclins, identifier les zones prioritaires à protéger, concevoir des politiques agricoles et d’aménagement plus intelligentes, et suivre l’efficacité des lois de conservation — des étapes essentielles si nous voulons préserver nos cultures, nos fleurs sauvages et nos écosystèmes en activité.

Citation: Sentil, A., Miličić, M., Benrezkallah, J. et al. Synthesised database of wild bee and hoverfly records in Europe. Sci Data 13, 227 (2026). https://doi.org/10.1038/s41597-026-06644-2

Mots-clés: pollinisateurs, abeilles sauvages, syrphes, données sur la biodiversité, Europe