L’ontologie des événements indésirables en 2025

Pourquoi il est important de suivre les effets secondaires médicaux

Chaque fois que nous prenons un médicament, recevons un vaccin ou subissons une intervention chirurgicale, il existe un risque d’effets indésirables. Médecins, autorités et chercheurs cherchent à surveiller de près ces « événements indésirables » pour détecter rapidement les schémas dangereux. Mais les rapports actuels sont dispersés dans de nombreuses bases de données, formulés de façons légèrement différentes et difficiles à analyser par des ordinateurs. Cet article présente un effort mondial en évolution appelé Ontology of Adverse Events (OAE), qui vise à fournir au monde médical un langage partagé et précis pour décrire les effets secondaires afin que les questions de sécurité puissent être traitées plus vite et de manière plus fiable.

Une carte commune pour les effets secondaires médicaux

Au fond, l’OAE ressemble à une carte détaillée décrivant la façon dont les effets secondaires médicaux sont exprimés. Plutôt que de simplement énumérer des noms de problèmes, elle les organise en familles logiques : où dans le corps ils surviennent, quelle est leur manifestation clinique (comme les symptômes ressentis par les patients, les signes mesurables par les médecins, ou les processus pathologiques sous-jacents) et comment ils se rapportent aux interventions médicales comme les médicaments, les vaccins et les dispositifs. Le projet a débuté en 2011 pour réduire la confusion entre vocabulaires médicaux concurrents. Une décision clé a été de distinguer soigneusement entre tout événement survenant après un traitement (un événement indésirable) et ceux pour lesquels il existe des preuves que le traitement a causé le problème (un événement indésirable causal). Cette séparation rend les analyses de sécurité moins biaisées et plus transparentes.

De petit catalogue à une riche encyclopédie

Au cours de la dernière décennie, l’OAE est passée de un peu plus de 3 000 termes à plus de 10 800 entrées uniques, soit une hausse d’environ 250 % reflétant à la fois un affinement des détails et une couverture clinique plus large. L’équipe a développé l’ontologie de plusieurs façons. Ils ont exploité de grandes bases de données de sécurité telles que le Vaccine Adverse Event Reporting System (VAERS) et la base de données de sécurité médicamenteuse de la FDA (FAERS) pour identifier des effets secondaires réels. Ils ont relié l’ontologie aux vocabulaires réglementaires largement utilisés comme MedDRA, et ont soigneusement enrichi de nouveaux termes issus des recherches sur la sécurité des vaccins et des médicaments. Chaque nouveau terme porte une étiquette lisible par un humain, une définition claire, des liens vers des références sources, sa localisation dans le corps et l’historique des modifications, rendant l’OAE à la fois traçable et facile à traiter par des ordinateurs.

Relier des données dispersées pour de meilleurs renseignements sur la sécurité

Parce que l’OAE respecte des normes communes pour les ontologies biomédicales, elle peut s’intégrer à de nombreux autres systèmes de connaissances spécialisés. Des chercheurs ont déjà construit des ontologies dérivées pour les effets secondaires de maladies particulières, pour des médicaments neurotoxiques et pour des traitements cardiaques. En alignant les termes de l’OAE avec des ontologies de l’anatomie, des gènes et des symptômes, les scientifiques peuvent tracer des trajectoires partant d’un médicament, passant par ses cibles moléculaires et les organes affectés, jusqu’aux effets secondaires observés chez les patients. Cela a permis de mettre au jour des réactions auparavant sous‑rapportées dans des séries de cas, de comparer les profils de sécurité de différents vaccins et d’explorer pourquoi certaines classes de médicaments tendent à affecter plusieurs systèmes corporels à la fois.

Appuyer la médecine de précision dans le monde

L’article souligne aussi la place de l’OAE dans le mouvement plus large vers la médecine de précision — l’idée d’adapter les traitements aux patients en fonction de leur biologie et de leur contexte de vie. Une description précise et lisible par machine des effets secondaires est essentielle si l’on veut assortir les médicaments et les vaccins aux personnes les plus susceptibles d’en bénéficier et les moins susceptibles d’être blessées. Le langage structuré de l’OAE permet de combiner et d’interroger de grands jeux de données de façon cohérente, autorisant des regroupements de patients plus fins et des vues du risque plus claires. En Chine, où les systèmes existants de signalement des effets secondaires des vaccins s’appuient sur des catégories larges et un libellé « autre » surutilisé, des chercheurs traduisent l’OAE en chinois et l’intègrent aux plateformes nationales de données pour apporter le même niveau de détail et d’interopérabilité à la surveillance locale.

Ce que cela signifie pour les patients et les cliniciens

Pour le lecteur non spécialiste, le message principal est que de meilleurs mots conduisent à une meilleure sécurité. En transformant un ensemble désordonné de descriptions d’effets secondaires en une référence soigneusement organisée, multilingue et adaptée aux ordinateurs, l’OAE aide les scientifiques à détecter plus tôt les signaux de sécurité, les régulateurs à comparer les produits de façon plus équitable et les cliniciens à comprendre comment les risques d’un traitement varient selon l’âge, le sexe, la maladie et d’autres facteurs. Les auteurs prévoient de continuer à étendre l’OAE vers des domaines plus spécialisés et à resserrer ses liens avec d’autres systèmes de connaissances médicales. Avec le temps, ce vocabulaire partagé pourrait rendre le monde complexe de la sécurité vaccinale et médicamenteuse plus transparent, plus réactif et, en fin de compte, plus sûr pour les patients partout.

Citation: Pan, C., Yang, Q., Zhang, X. et al. The Ontology of Adverse Events in 2025. Sci Data 13, 259 (2026). https://doi.org/10.1038/s41597-026-06584-x

Mots-clés: événements indésirables, sécurité des médicaments, sécurité des vaccins, ontologie médicale, médecine de précision