Ernährung und Umweltfaktoren treiben gemeinsam das Darmmikrobiom, Resistom und Virulom urbaner Fledermäuse

Warum Fledermäuse in Städten für die menschliche Gesundheit wichtig sind

Mit der Ausdehnung von Städten leben Menschen näher denn je an Wildtieren. Zu unseren meistübersehenen Nachbarn zählen Fledermäuse, die unter Brücken und in Gebäuden ruhen. Diese Tiere durchqueren jede Nacht städtische und ländliche Räume und fressen Insekten, die Rückstände von landwirtschaftlichen Chemikalien und Antibiotika tragen können. Diese Studie stellt eine aktuelle Frage: Wie formen Stadtleben und Ernährung die Darmmikroben von Fledermäusen — und die Gene, die Bakterien resistent gegen Medikamente machen oder ihre Schädlichkeit erhöhen — und welche Folgen könnte das für die öffentliche Gesundheit haben?

Was die Wissenschaftler untersuchen wollten

Forscher im Nordosten Chinas konzentrierten sich auf die Asiatische Fleckenfledermaus, eine Art, die häufig in großen Mutterkolonien an städtischen Bauwerken lebt. Sie sammelten Kotproben von 60 Fledermäusen während Schwangerschaft, Geburt und Laktation sowie von nahegelegenen ländlichen Kolonien und subadulten Tieren. Statt einzelne Mikroben zu untersuchen, nutzten sie „Meta-Omics“-Ansätze — sie lasen die gesamte DNA in den Proben — um gleichzeitig drei Dinge zu kartieren: das Darmmikrobiom (alle vorhandenen Bakterien), das „Resistom“ (Antibiotikaresistenzgene) und das „Virulom“ (Gene, die Bakterien krankmachender machen können). Außerdem analysierten sie die Ernährung der Fledermäuse mittels Insekten-DNA und maßen Dutzende Antibiotikarückstände im Kot.

Was im Darm einer Fledermaus lebt

Das Team fand heraus, dass die Därme dieser Stadtfledermäuse mit vielfältigen Bakterien sowie zahlreichen Resistenz- und Virulenzgenen gefüllt sind, und zwar in ähnlichen Mengen wie in belasteten Umgebungen wie Abwässern oder Viehmist. Die meisten Darmbakterien gehörten zu einigen wenigen großen Gruppen; Gattungen wie Clostridium, Klebsiella, Enterobacter, Lactococcus und Escherichia waren besonders häufig. Resistenzgene deckten ein breites Spektrum an Wirkstoffklassen ab, darunter Multidrug- und Chinolonresistenzen, während Virulenzgene mit Eigenschaften verknüpft waren wie Anheftung an Wirtsgewebe, Bewegung im Körper und Umgehung des Immunsystems. Untersuchten die Forscher jedoch die Lage dieser Gene in bakteriellen Genomen, so zeigten sich die meisten auf Chromosomen oder nicht-mobilen Plasmiden und nur selten mit mobilen genetischen Elementen verknüpft — was darauf hindeutet, dass ihre Fähigkeit, zwischen Bakterien zu springen, begrenzt ist.

Stadtleben, Ort und Zeit formen den verborgenen Genpool

Die Studie verglich Fledermäuse aus zwei ländlichen Standorten mit solchen aus der Stadt. Die Geografie erwies sich als wichtig: Die drei Standorte unterschieden sich deutlich in bakteriellen Gemeinschaften sowie in Mustern von Resistenz- und Virulenzgenen. Ein ländlicher Standort wies tatsächlich die reichhaltigste Sammlung solcher Gene auf, was darauf hindeutet, dass lokale Verschmutzung oder landwirtschaftliche Praktiken dort intensiver sein könnten als in der nahegelegenen Stadt. Über die Fortpflanzungssaison — von der späten Schwangerschaft bis zum Abstillen — veränderte sich die Darmgemeinschaft der Fledermäuse ebenfalls. Sowohl Resistenz- als auch Virulenzgene nahmen im Allgemeinen im Verlauf zu und folgten Veränderungen in Schlüsselbakteriengruppen, besonders Clostridium. Statistische Analysen zeigten, dass diese Muster nicht zufällig waren, sondern von konsistenten Umwelteinflüssen getrieben wurden, statt von zufälliger Neuordnung.

Ernährung und Antibiotika als stille Treiber

Da diese Fledermäuse gefräßige Insektenfresser sind, untersuchten die Forscher, wie Nahrung und Arzneimittelrückstände mit dem Darmgenpool zusammenhängen. DNA-Barcoding zeigte, dass Fledermäuse Insekten aus mindestens 16 Ordnungen verzehrten, dominiert von Fliegen und Nachtfaltern. Die Ernährung wurde von der Schwangerschaft zur Laktation hin vielfältiger, wahrscheinlich aufgrund höherer Energiebedürfnisse und saisonaler Veränderungen in der Verfügbarkeit von Insekten. Chemische Analysen zeigten, dass der Kot mehrere Antibiotikaklassen enthielt, insbesondere Sulfonamide, Chinolone und Makrolide, mit höheren Konzentrationen bei Stadttieren als bei den meisten Landtieren. Die Zusammensetzung der Nahrung stimmte stark mit den Antibiotikaprofilen überein, was nahelegt, dass die Ernährung die Tiere Arzneimittelrückständen aussetzt. Im Gegenzug korrelierten spezifische Antibiotika mit dem Vorkommen und der Häufigkeit passender Resistenzgene — etwa stiegen Aminoglykosid-Konzentrationen parallel zu Aminoglykosid-Resistenzgenen — was darauf hindeutet, dass diätetische Antibiotikabelastung resistente Bakterien im Darm selektiert.

Was offenbar weniger wichtig ist

Das Team prüfte auch, ob individuelle Merkmale der Fledermäuse — wie Geschlecht, Alter, Körpergröße oder Fortpflanzungsstatus — das Darmmikrobiom oder dessen Resistenz- und Virulenzgeninhalt veränderten. In ihrem Datensatz machten diese Wirtsmerkmale wenig Unterschied. Subadulte Fledermäuse, die gerade abgestillt waren und selbstständig zu fressen begannen, trugen bereits Resistenz- und Virulenzgenprofile, die den erwachsener Tiere ähnelten. Die Autoren vermuten, dass gemeinsame Ruheplätze, weite nächtliche Bewegungen und die gemeinsame Exposition gegenüber gleichen Insektenbeutetieren und Umweltverschmutzungen subtile individuelle Unterschiede überlagern können.

Was das für Menschen und Ökosysteme bedeutet

Die wichtigste Botschaft für Laien lautet: Stadttiere wie Fledermäuse sind nicht nur Schädlingsvertilger; ihre Därme spiegeln die chemischen und mikrobiellen Belastungen der von ihnen genutzten Umgebungen wider. Ernährung und Lebensraum steuern mehr als die Biologie der Fledermäuse selbst, welche Mikroben sowie Resistenz- oder Virulenzgene in ihnen gedeihen. Auch wenn die von ihnen getragenen Gene offenbar nur begrenzt zwischen Bakterien springen können, machen die Befunde Fledermäuse zu wichtigen Indikatoren für das Eindringen von Antibiotika und Schadstoffen aus Landwirtschaft, Städten und Gewässern in die Tierwelt. Die Überwachung dieser Tiere hilft zu verstehen, wie unser Einsatz von Antibiotika und anderen Chemikalien urbane Ökosysteme beeinflusst — und wie diese Auswirkungen letztlich auf die menschliche Gesundheit zurückwirken können.

Zitation: Huang, L., Pu, YT., Zhao, YH. et al. Diet and environmental factors jointly drive the gut microbiome, resistome, and virulome of urban bats. npj Biofilms Microbiomes 12, 61 (2026). https://doi.org/10.1038/s41522-026-00930-y

Schlüsselwörter: städtische Fledermäuse, Darmmikrobiom, Antibiotikaresistenzgene, Umweltverschmutzung, Wildtier One Health